More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2729 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  282  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  86.01 
 
 
143 aa  245  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  72.34 
 
 
147 aa  209  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  68.35 
 
 
163 aa  181  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  70.99 
 
 
155 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  70.99 
 
 
155 aa  179  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  70.99 
 
 
155 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  38.52 
 
 
159 aa  89.7  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 
146 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  46.15 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  36.3 
 
 
161 aa  76.6  0.00000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
152 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  41.28 
 
 
171 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  36.8 
 
 
159 aa  67.8  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  40.95 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.85 
 
 
173 aa  67.4  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
208 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.6 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 
148 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 
155 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  43.27 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
162 aa  63.9  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  32.85 
 
 
143 aa  62  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.59 
 
 
171 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  33.33 
 
 
157 aa  61.2  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  32.33 
 
 
189 aa  58.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
150 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0044  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
193 aa  58.5  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2017  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  33.83 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 
150 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
151 aa  57.4  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
142 aa  57.4  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  36.11 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
151 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  32.41 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
151 aa  55.5  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4471  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.155618  normal  0.207869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
156 aa  54.3  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 
142 aa  54.3  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
143 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.09 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  35.56 
 
 
157 aa  53.9  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
139 aa  53.9  0.0000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  37.38 
 
 
153 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
144 aa  53.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 
162 aa  53.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  31.06 
 
 
144 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 
174 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
159 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  40.22 
 
 
172 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  32.56 
 
 
163 aa  52  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0143  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000387335  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  34.88 
 
 
153 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  44.59 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  32.46 
 
 
190 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 
175 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 
147 aa  50.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
175 aa  50.8  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
139 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 
164 aa  50.8  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
152 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
155 aa  50.4  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 
159 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 
201 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.59 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0148  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
151 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
158 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2500  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.394742  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  32.32 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 
154 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  37.21 
 
 
157 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
140 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>