More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2307 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  40.56 
 
 		 149 aa  95.9  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 151 aa  94.7  3e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 143 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 151 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  39.31 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  40.15 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 147 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 162 aa  77.8  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  35.66 
 
 		 150 aa  77.4  0.00000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 157 aa  77  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.69 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 163 aa  76.6  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  37.59 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  37.58 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 162 aa  73.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 139 aa  72.8  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  41.49 
 
 		 153 aa  70.5  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  36.88 
 
 		 151 aa  70.1  0.000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  37.82 
 
 		 145 aa  69.7  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  38.46 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  34.23 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 144 aa  67.4  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  34.01 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 149 aa  65.9  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  33.11 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 151 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 146 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 143 aa  65.1  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  32.37 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  34.46 
 
 		 150 aa  65.5  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  37.69 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 163 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  39.81 
 
 		 163 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  38.32 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  34.26 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 151 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  35.17 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2570  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00196681  hitchhiker  0.000397259 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 144 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 165 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 150 aa  57  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2923  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 158 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 150 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>