More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2935 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  290  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 147 aa  74.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 155 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 155 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  42.53 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  40.5 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 		 173 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  40.74 
 
 		 160 aa  65.9  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 187 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 		 174 aa  62.4  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 173 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  38.83 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  46.84 
 
 		 161 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 158 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  34.74 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.25 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0516  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.716514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3435  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  38.68 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3610  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  35.77 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  31.53 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  43.53 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 152 aa  54.7  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 161 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  35.45 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  40.66 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  39.29 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.85 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 188 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  40.96 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 155 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.82 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3930  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018359  hitchhiker  0.00457936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  33.33 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 156 aa  50.8  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  36.84 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 		 173 aa  50.8  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.68 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  31.76 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  31.76 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 148 aa  50.1  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  45.21 
 
 		 172 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  39.19 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  37 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  46.67 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 170 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 299 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1101  transcriptional regulator, MarR family  36.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.54322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 148 aa  48.9  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 		 158 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0238  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.503639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  34.56 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>