57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4204 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  314  3e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  50.99 
 
 		 153 aa  140  5e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  39.86 
 
 		 152 aa  85.9  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 154 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0886  transcriptional regulator, MarR family  33.56 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.221298  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  36.61 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.25 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  34.81 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32.84 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  35.97 
 
 		 166 aa  53.9  0.0000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  32.46 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  30.89 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  31.36 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  27.07 
 
 		 164 aa  51.2  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.23 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 643 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  27.52 
 
 		 643 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  27.52 
 
 		 643 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  37.61 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  40.3 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 150 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 174 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 161 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 175 aa  44.3  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 		 162 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 144 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 174 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 143 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 138 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 149 aa  40.4  0.01  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  27.97 
 
 		 162 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  30.17 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>