More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4803 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  291  2e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  44.27 
 
 		 172 aa  130  6e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  52.63 
 
 		 142 aa  114  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 161 aa  98.2  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  44.2 
 
 		 166 aa  93.6  9e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  38.17 
 
 		 155 aa  87.4  6e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  39.23 
 
 		 174 aa  82  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  43.59 
 
 		 172 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  39.83 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 192 aa  70.9  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 152 aa  70.5  0.000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  43.88 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  41.35 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  38.28 
 
 		 146 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  36.69 
 
 		 153 aa  67  0.00000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  39.66 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  40.57 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 154 aa  64.7  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 169 aa  65.1  0.0000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.84 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 159 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 157 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4565  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  50.65 
 
 		 201 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  34.03 
 
 		 164 aa  57  0.00000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  36.79 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  35.58 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 146 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  37.78 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12350  hypothetical protein  35.48 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 334 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 158 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 151 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10041  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.964365 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  38.96 
 
 		 162 aa  50.8  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  31.96 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 157 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  37.5 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  37.5 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  33.8 
 
 		 283 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  33.98 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  32.54 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 168 aa  48.9  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 313 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  40.32 
 
 		 158 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.7 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  46.3 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 154 aa  47.4  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 156 aa  47.4  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 183 aa  47  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>