110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  100 
 
 
164 aa  327  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 
165 aa  122  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.99 
 
 
165 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0731  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 
156 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000118752  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.03 
 
 
154 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06310  transcriptional regulator  33.04 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 
158 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
178 aa  50.4  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  27.27 
 
 
148 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  32.05 
 
 
283 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 
173 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.28 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
192 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  32.31 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1609  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 
172 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  30.38 
 
 
109 aa  48.9  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 
174 aa  48.5  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 
175 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0751  transcriptional regulator, MarR family  34.34 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  31.25 
 
 
165 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4699  hypothetical protein  34.83 
 
 
160 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.158619  normal  0.0406729 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2658  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
169 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.563591  normal  0.690586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
171 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
165 aa  47  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
163 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  34.38 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
154 aa  45.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4007  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.063729 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 
174 aa  45.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5020  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
139 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4486  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
147 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.021686  normal  0.0998703 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 
156 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
329 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4112  regulatory protein MarR  36.75 
 
 
179 aa  44.3  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 
161 aa  44.3  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
159 aa  44.3  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 
213 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.4 
 
 
132 aa  43.9  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
176 aa  43.9  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
146 aa  43.9  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2693  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116761  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1010  transcriptional regulator  32.1 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000024203  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  32.52 
 
 
213 aa  43.9  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1858  MarR family transcriptional regulator  35.24 
 
 
196 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.642234  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1213  transcriptional regulator, MarR family  23.7 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0032  transcriptional regulator, MarR family  40.28 
 
 
201 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  38.03 
 
 
160 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  24.63 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
161 aa  43.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
176 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
150 aa  43.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0154  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
324 aa  43.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.372672  normal  0.054252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 
219 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
201 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.78 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.08 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 
152 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2633  transcriptional regulator protein-like protein  48 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  30 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0761  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
145 aa  42.4  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0154826  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3618  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.50138  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0709  MarR family transcriptional regulator  27.47 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.699549  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  22.07 
 
 
165 aa  42.4  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 
157 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  30.4 
 
 
186 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04490  MarR family regulator  30.39 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  32.56 
 
 
138 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
161 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2780  MarR family transcriptional regulator  26.12 
 
 
139 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00474606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 
146 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 
159 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0139  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
117 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
144 aa  41.6  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
157 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  33.33 
 
 
261 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1949  transcriptional regulator TcaR  26.36 
 
 
151 aa  41.2  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
143 aa  41.2  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
200 aa  41.2  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
322 aa  41.2  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
161 aa  41.2  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 
150 aa  41.2  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3574  transcriptional regulator, MarR family  32.94 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.930143  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
159 aa  41.2  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
170 aa  40.8  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
219 aa  41.2  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
174 aa  41.2  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>