88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1639 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 161 aa  316  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  47.89 
 
 		 158 aa  129  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  36.28 
 
 		 155 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.61 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  35.07 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  25.19 
 
 		 174 aa  58.2  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.43 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 150 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 155 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.84 
 
 		 283 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  26.87 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 157 aa  48.5  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 178 aa  47.8  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 172 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  29.37 
 
 		 169 aa  47.8  0.00007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  27.27 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 175 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0337  putative transcriptional regulator  38.24 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  25.23 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  30.3 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  31.15 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 187 aa  45.4  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 352 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 340 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  28.08 
 
 		 174 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 340 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  28.85 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 		 165 aa  44.7  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 154 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  21.09 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2469  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  27.59 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  30.37 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  31.48 
 
 		 159 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0916  MarR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 309 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 142 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 320 aa  43.1  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  28.57 
 
 		 312 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 159 aa  42  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 156 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 313 aa  42.4  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 146 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  32.32 
 
 		 144 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  26.52 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 138 aa  42  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 148 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 158 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 145 aa  41.2  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  31.37 
 
 		 140 aa  41.2  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  25.84 
 
 		 349 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 164 aa  40.8  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26770  transcriptional regulator  37.66 
 
 		 143 aa  41.2  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.462965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  28.89 
 
 		 301 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 349 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3065  transcriptional regulator, MarR family protein  21.11 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  26.53 
 
 		 143 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1815  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.47 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1650  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.47 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1625  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.47 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1692  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.47 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1633  DNA-binding transcriptional repressor MarR  25.47 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.400135  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 347 aa  40.8  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 154 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6031  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 		 159 aa  40.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>