More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3635 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 158 aa  315  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 170 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 158 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 152 aa  74.7  0.0000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  37.84 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  37.61 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0886  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.221298  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  34.35 
 
 		 154 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 201 aa  64.3  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  37.17 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 162 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 172 aa  60.5  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  35.58 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6961  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 157 aa  57.4  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.866356  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  27.78 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  27.7 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  41.43 
 
 		 156 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 173 aa  53.5  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 175 aa  52.8  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  32 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 147 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 		 161 aa  51.2  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2992  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 167 aa  51.6  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.598417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 165 aa  51.2  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2823  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 148 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  29.52 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 		 188 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 162 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  31.53 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.94 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  43.28 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  29.36 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3895  regulatory protein MarR  34.41 
 
 		 167 aa  48.9  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.91 
 
 		 154 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 153 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 136 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1356  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 156 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 167 aa  48.1  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  25.37 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 154 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3146  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 168 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5755  transcriptional regulator, MarR family  34.41 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373966 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 152 aa  47.8  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  28.57 
 
 		 283 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5017  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 180 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.211295  normal  0.268474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1051  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1067  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 185 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.124538 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>