More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_0549 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 157 aa  315  2e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.32 
 
 		 160 aa  90.9  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.12 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 173 aa  74.3  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  36.04 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  34.43 
 
 		 155 aa  64.3  0.0000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.23 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  35.65 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  34.17 
 
 		 174 aa  62.8  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  38.64 
 
 		 157 aa  60.1  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  46.05 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 173 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  38.82 
 
 		 283 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2777  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 		 158 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158506  normal  0.392987 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1740  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.140466  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  37.11 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  35 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4146  regulatory protein MarR  38.89 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.355726  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 164 aa  56.2  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 167 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  32.62 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 176 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 165 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4248  transcriptional regulator, MarR family  37.38 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.921618 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  30.59 
 
 		 161 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.76 
 
 		 187 aa  52.8  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  36.61 
 
 		 156 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  28.36 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 152 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 165 aa  51.2  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 176 aa  50.8  0.000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  35.16 
 
 		 157 aa  50.8  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  33.68 
 
 		 140 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  28.57 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  28.1 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 174 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  28.45 
 
 		 175 aa  50.8  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  32.74 
 
 		 146 aa  50.4  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 138 aa  50.4  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 142 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  32.38 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 		 201 aa  49.7  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0520  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 150 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.606066  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3991  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00156132  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3822  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000229198  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  32.52 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 162 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4303  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0482862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4103  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 139 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.6454e-44 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 138 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2466  Transcriptional regulators-like protein  41.43 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0564534  normal  0.0878491 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  36.99 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1308  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0396226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  29 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 158 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 147 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 340 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 326 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0963  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.09 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>