270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4671 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 173 aa  331  3e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  42.76 
 
 		 172 aa  94.4  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  41.67 
 
 		 160 aa  83.6  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 178 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  40.52 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  38.53 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  34.9 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  34.52 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  41.44 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 192 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  35.42 
 
 		 174 aa  63.2  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  41.58 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 173 aa  60.1  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  37.7 
 
 		 161 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  35.96 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  36.19 
 
 		 165 aa  58.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  32.77 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  35.35 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 164 aa  55.5  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 158 aa  55.1  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0190  transcriptional regulator, MarR family  33.99 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 152 aa  53.1  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 174 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 162 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  43.42 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 158 aa  52.4  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 		 158 aa  52  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  37.93 
 
 		 151 aa  51.2  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 139 aa  51.2  0.000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 165 aa  50.8  0.000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 142 aa  50.8  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  32.04 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  39.18 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.97 
 
 		 152 aa  50.8  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0391  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 160 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 151 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0289  MarR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 160 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  33.96 
 
 		 157 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  33.67 
 
 		 145 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  32.22 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0791  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000107079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  38.2 
 
 		 151 aa  48.9  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 162 aa  48.5  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3912  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 150 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0139173  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  29 
 
 		 139 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  32.39 
 
 		 144 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5359  transcriptional regulator, MarR family  29.68 
 
 		 156 aa  48.5  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.157923  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  39 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 139 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 643 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  29.89 
 
 		 139 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  34.55 
 
 		 643 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 152 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 643 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  30.32 
 
 		 174 aa  47.8  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>