79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7314 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  100 
 
 
173 aa  340  5e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  42.25 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  36.09 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 
165 aa  64.3  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  36.36 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
176 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
158 aa  60.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
176 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1034  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
157 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  40.45 
 
 
165 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  39.53 
 
 
160 aa  56.2  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  31.62 
 
 
164 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  41.24 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 
166 aa  52.4  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 
161 aa  50.8  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.47 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27.52 
 
 
283 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  35.56 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.25 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 
165 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
149 aa  48.5  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 
164 aa  47.8  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
163 aa  47.4  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.93 
 
 
141 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  30.77 
 
 
175 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1926  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.609155  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
174 aa  46.2  0.0002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6153  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.834602  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1972  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.195696  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
157 aa  45.8  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 
173 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.14 
 
 
145 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  30.51 
 
 
149 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2694  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  35.29 
 
 
227 aa  45.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0485756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  26.21 
 
 
301 aa  45.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 
189 aa  44.7  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  24.73 
 
 
203 aa  44.7  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  27.17 
 
 
141 aa  44.7  0.0007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  32.32 
 
 
178 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
170 aa  44.3  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3299  transcriptional regulator, MarR family  34.68 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.416393  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01480  transcriptional regulator  32.14 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  36.92 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 
321 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  30.95 
 
 
156 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  41.07 
 
 
149 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 
136 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
192 aa  42.4  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
155 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
153 aa  42.4  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  30.95 
 
 
165 aa  42  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3035  regulatory protein, MarR  34.31 
 
 
153 aa  42  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  0.4282 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  37.63 
 
 
160 aa  42  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 
145 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  19.83 
 
 
145 aa  41.6  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  30.91 
 
 
153 aa  42  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 
172 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
136 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
325 aa  41.6  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
136 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0694  regulatory protein, MarR  29.31 
 
 
171 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.46 
 
 
174 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
161 aa  40.8  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>