67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4811 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
163 aa  325  2.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  47.22 
 
 
165 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 
175 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  42.47 
 
 
165 aa  90.5  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  40.71 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1175  transcriptional regulator MarR family  41.01 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 
173 aa  60.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  40.7 
 
 
178 aa  58.5  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3648  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 
158 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325273  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  37.65 
 
 
160 aa  55.5  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
172 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  32.26 
 
 
151 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 
162 aa  51.6  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0861  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
334 aa  50.8  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
152 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
163 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0904  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
158 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0921  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
176 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 
146 aa  48.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4413  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 
164 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0910  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
176 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0236829  normal  0.0112951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6482  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 
172 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.618469  normal  0.143744 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33630  transcriptional regulator  37.84 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.120194  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  25.25 
 
 
174 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003893  transcriptional regulator  27.21 
 
 
151 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0737  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
322 aa  45.1  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  25.26 
 
 
151 aa  44.3  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  25.26 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  27.27 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  39.44 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
166 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 
161 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
191 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
411 aa  42.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0330  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
141 aa  42.4  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
149 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  25.61 
 
 
155 aa  42  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.75 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
151 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
151 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  27.92 
 
 
150 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
151 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  28.09 
 
 
151 aa  41.6  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
170 aa  41.6  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5046  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
172 aa  41.6  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
154 aa  41.2  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3512  transcriptional regulator, MarR family  33.93 
 
 
140 aa  41.2  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226804  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0298  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
160 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  25.27 
 
 
312 aa  41.2  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  36.07 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 
155 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4212  MarR family transcriptional regulator  18.97 
 
 
191 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.526532  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
160 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  29.17 
 
 
165 aa  40.8  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  25.17 
 
 
154 aa  40.8  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  24.11 
 
 
159 aa  40.4  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>