68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3512 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3512  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
140 aa  283  5e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00226804  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0265  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
154 aa  98.6  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1998  MarR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
154 aa  96.7  8e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
185 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  25.51 
 
 
188 aa  46.2  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  25.96 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.32 
 
 
145 aa  46.2  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  25.96 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  25.96 
 
 
144 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  29.35 
 
 
173 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  28.71 
 
 
176 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  29.03 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  29.03 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  29.03 
 
 
170 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
176 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
171 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  22.31 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  29.41 
 
 
176 aa  43.5  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06420  transcriptional regulator  24.47 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
177 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  23.15 
 
 
148 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  23.15 
 
 
148 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
142 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  30.11 
 
 
176 aa  42.7  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0576  transcriptional regulator, TrmB  33.82 
 
 
158 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0950259  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  22.22 
 
 
148 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
142 aa  42  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
162 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0390  transcriptional regulator, MarR family  22.88 
 
 
165 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.471092  normal  0.0364487 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  25.86 
 
 
187 aa  41.6  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  32.58 
 
 
171 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  31.11 
 
 
170 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
148 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  22.22 
 
 
148 aa  42  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
140 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
155 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 
142 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
154 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  41.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  23.23 
 
 
137 aa  40.8  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
166 aa  40.8  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0492  AsnC family transcriptional regulator  24.43 
 
 
174 aa  40.8  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.944149  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4811  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
163 aa  40.8  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.613467  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3728  transcriptional regulator, MarR family  23.28 
 
 
161 aa  40.4  0.007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  23.53 
 
 
162 aa  40.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26700  transcriptional regulator, MarR family  22.52 
 
 
162 aa  40.8  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.297674 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 
172 aa  40.8  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2341  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 
154 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>