182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0851 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 172 aa  335  2.9999999999999997e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  54.94 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  52.53 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  52.44 
 
 		 183 aa  153  9e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  51.81 
 
 		 169 aa  151  4e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  51.9 
 
 		 169 aa  151  5e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 		 172 aa  140  8e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  49.38 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  54.79 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  51.06 
 
 		 184 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  57.41 
 
 		 191 aa  121  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  51.11 
 
 		 187 aa  121  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  57.41 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  51.59 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  54.43 
 
 		 172 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 226 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 187 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  48.46 
 
 		 183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  50.79 
 
 		 163 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 169 aa  117  9e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 169 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  48.46 
 
 		 186 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  47.33 
 
 		 154 aa  111  5e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 237 aa  111  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 173 aa  111  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 185 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  44.12 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 160 aa  101  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 160 aa  101  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 160 aa  99.8  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 158 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  35.26 
 
 		 160 aa  99  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  48 
 
 		 167 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 160 aa  94  8e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  48.8 
 
 		 152 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 157 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  41.54 
 
 		 156 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 146 aa  84.3  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 148 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  35.14 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  31.45 
 
 		 151 aa  70.1  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1510  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.48899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 169 aa  53.9  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 138 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 138 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2288  transcriptional regulator, MarR family  40.23 
 
 		 140 aa  52  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.068173 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 155 aa  51.6  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 146 aa  51.2  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 156 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  28.93 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 159 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 140 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 140 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.85 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1265  transcriptional regulator, MarR family  29.67 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4564  Transcriptional regulators-like protein  35.21 
 
 		 261 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  0.0271107 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  24.79 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1031  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 173 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.552189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5172  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 151 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 193 aa  45.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0722  transcriptional regulator, MarR family  39.22 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.702858  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1540  regulatory protein, MarR  28.83 
 
 		 175 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0757127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0570  transcriptional regulator, MarR family  31.88 
 
 		 182 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0078  MarR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742526  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  31.3 
 
 		 167 aa  45.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  32.43 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>