150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3286 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 183 aa  356  9e-98  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 172 aa  167  9e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  52.35 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  45.96 
 
 		 168 aa  144  6e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  45.34 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  44.91 
 
 		 175 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  43.62 
 
 		 187 aa  119  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 172 aa  114  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  40.11 
 
 		 185 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 182 aa  108  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 		 183 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 169 aa  107  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 186 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  42.75 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  49.52 
 
 		 191 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  49.52 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 179 aa  98.2  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 226 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 237 aa  98.2  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 184 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 160 aa  97.4  9e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  33.57 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 		 160 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  40.41 
 
 		 179 aa  96.7  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 160 aa  92.4  4e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 146 aa  91.3  8e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  43.7 
 
 		 154 aa  85.1  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  41.48 
 
 		 152 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 147 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 148 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  31.2 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 157 aa  74.3  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 145 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  33.59 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  34.09 
 
 		 148 aa  65.9  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 146 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 203 aa  51.2  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 233 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 161 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 150 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  20.54 
 
 		 146 aa  47.8  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  26.77 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 144 aa  47.4  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 154 aa  47.4  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 161 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7681  CbaR  23.42 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0113297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 171 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 154 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 169 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3544  general secretion pathway protein G  25.89 
 
 		 140 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000274638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 164 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  44.7  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1189  transcriptional regulator MarR family  32.32 
 
 		 158 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.622384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0977  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  32.22 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3426  transcriptional regulator, MarR family  33.75 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0866  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3498  MarR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 165 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 		 161 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>