121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7271 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 184 aa  364  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  83.78 
 
 		 226 aa  300  6.000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  65.09 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  65.27 
 
 		 191 aa  204  5e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  65.61 
 
 		 187 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  72.73 
 
 		 181 aa  191  6e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  59.51 
 
 		 183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  58.08 
 
 		 172 aa  180  1e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 169 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  61.48 
 
 		 183 aa  170  9e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 185 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  56.21 
 
 		 169 aa  170  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 185 aa  167  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 186 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  57.78 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  60.61 
 
 		 160 aa  163  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  54.48 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 173 aa  161  6e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  53.9 
 
 		 179 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  59.09 
 
 		 163 aa  154  7e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  59.09 
 
 		 163 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  52.52 
 
 		 168 aa  141  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  55.38 
 
 		 154 aa  139  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  53.08 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 169 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 179 aa  122  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  56.78 
 
 		 172 aa  120  8e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  58.06 
 
 		 169 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 172 aa  106  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 146 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  55.43 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  55.43 
 
 		 167 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 157 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 160 aa  98.6  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 		 160 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 160 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 160 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 158 aa  93.6  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  39.29 
 
 		 151 aa  92.8  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 187 aa  91.7  6e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 145 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 160 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 147 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.74 
 
 		 148 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.01 
 
 		 156 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  41.13 
 
 		 183 aa  85.5  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 155 aa  77  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  38.95 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 159 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 160 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4344  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 144 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747818  normal  0.0412659 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 162 aa  48.5  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 146 aa  48.1  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 157 aa  48.1  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 162 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 157 aa  46.2  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 142 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  33.8 
 
 		 148 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 191 aa  45.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  32.32 
 
 		 161 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2302  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0413  MarR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 151 aa  44.7  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.019986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0033  MarR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.674408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 147 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  28.92 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 144 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2471  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 321 aa  43.5  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.536093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3635  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 142 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.96 
 
 		 151 aa  43.5  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5489  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 154 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12901  transcriptional regulator  34.21 
 
 		 139 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.562288  normal  0.906652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 153 aa  42.7  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 163 aa  42.4  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 150 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0810  MarR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 184 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300222  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 157 aa  42  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3259  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 167 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0457343  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>