56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4350 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  339  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 169 aa  65.9  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  37.27 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 170 aa  64.3  0.0000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 172 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  32.86 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 148 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  33.61 
 
 		 156 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 158 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  33.57 
 
 		 147 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 167 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 160 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  51.2  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 145 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 160 aa  50.8  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  26.39 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 146 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  29.45 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 172 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 163 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 		 163 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 237 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  25.74 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 172 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 155 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  28.57 
 
 		 154 aa  41.2  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 140 aa  40.8  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>