93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2787 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
169 aa  341  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  95.27 
 
 
169 aa  330  6e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  94.08 
 
 
169 aa  327  6e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  78.44 
 
 
170 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  77.64 
 
 
169 aa  252  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  75.9 
 
 
168 aa  249  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  80 
 
 
172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  53.16 
 
 
172 aa  153  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 
179 aa  150  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  48.25 
 
 
172 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  49.65 
 
 
183 aa  137  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  53.08 
 
 
184 aa  134  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  51.45 
 
 
226 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  47.77 
 
 
187 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 
175 aa  127  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
174 aa  125  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  51.18 
 
 
154 aa  125  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
160 aa  124  9e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  45.74 
 
 
169 aa  122  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.61 
 
 
160 aa  121  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  50 
 
 
187 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  41.91 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  41.79 
 
 
160 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
160 aa  118  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  45.34 
 
 
183 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  46.51 
 
 
169 aa  118  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  53.57 
 
 
191 aa  117  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 
163 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  53.57 
 
 
191 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
182 aa  117  7.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  45.74 
 
 
163 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
173 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 
183 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
237 aa  114  6e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 
179 aa  114  6e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  43.51 
 
 
186 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  48.2 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
185 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  41.86 
 
 
185 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
160 aa  106  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
158 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  46.34 
 
 
157 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
145 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
147 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  45.19 
 
 
152 aa  95.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  44.44 
 
 
167 aa  94.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
147 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  41.41 
 
 
156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
155 aa  84  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.68 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  33.64 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
181 aa  56.2  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  33.65 
 
 
156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
161 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 
325 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  32 
 
 
319 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
326 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
326 aa  45.8  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
174 aa  45.4  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4303  transcriptional regulator, MarR family  27.55 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7562  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
326 aa  44.7  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.774028 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  44.3  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
191 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
144 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  36.71 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
166 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 
163 aa  42  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  22.92 
 
 
148 aa  42  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
146 aa  42  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
153 aa  42  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
321 aa  41.6  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
326 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0178  transcriptional regulator, MarR family  29.17 
 
 
180 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  34.55 
 
 
172 aa  41.2  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
336 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
153 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 
162 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1971  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 
162 aa  40.8  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.30149  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  22.68 
 
 
152 aa  40.8  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>