106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3429 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  290  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  96.5 
 
 
167 aa  242  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  96.43 
 
 
167 aa  235  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
160 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  39.26 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  39.85 
 
 
160 aa  126  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  48.95 
 
 
146 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
179 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  37.78 
 
 
158 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
160 aa  121  3e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  47.14 
 
 
168 aa  121  4e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  50.41 
 
 
145 aa  120  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  41.73 
 
 
172 aa  120  9e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  47.37 
 
 
158 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  47.48 
 
 
183 aa  118  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  46.83 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  46.62 
 
 
157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
169 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  44.37 
 
 
156 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 
169 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  42.22 
 
 
147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
172 aa  108  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  50.41 
 
 
184 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
226 aa  106  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  41.84 
 
 
147 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
155 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
163 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
186 aa  103  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  40.46 
 
 
169 aa  102  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
182 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  43.8 
 
 
174 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 
163 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  52.08 
 
 
181 aa  100  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  48.11 
 
 
191 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 
191 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  48.11 
 
 
187 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  40.16 
 
 
183 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  40.31 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  44.66 
 
 
185 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
169 aa  95.5  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
172 aa  95.5  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 
173 aa  95.5  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  39.42 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  44.04 
 
 
237 aa  94  6e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
179 aa  94  7e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  47.62 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  39.72 
 
 
175 aa  91.7  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 
179 aa  90.9  6e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 
151 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  31.85 
 
 
151 aa  89  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  40.14 
 
 
187 aa  87  8e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  41.01 
 
 
183 aa  85.5  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  31.06 
 
 
148 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  39.25 
 
 
181 aa  56.6  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  25.23 
 
 
144 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  35.2 
 
 
162 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
223 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
326 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.29 
 
 
146 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  32.59 
 
 
146 aa  43.9  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  37.66 
 
 
336 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
163 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  29.37 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  34.18 
 
 
153 aa  42.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4285  transcriptional regulator, MarR family  34.48 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 
151 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0172  transcriptional regulator, MarR family protein  28.26 
 
 
151 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2343  hypothetical protein  30.63 
 
 
143 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
159 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 
157 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
154 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
147 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
148 aa  42.4  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  19.31 
 
 
165 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 
170 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
169 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0290  transcriptional regulator, MarR family protein  28.26 
 
 
151 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  36.08 
 
 
158 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
161 aa  42  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  29.82 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
161 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2015  GCN5-related N-acetyltransferase  28.12 
 
 
306 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0853  MarR family transcriptional regulator  18.87 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0548  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 
143 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 
203 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5333  transcriptional regulator, MarR family  29.52 
 
 
154 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.828951 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6026  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
325 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  25.64 
 
 
171 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2725  putative transcription regulator protein  26.55 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.612085  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>