118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2224 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 179 aa  354  3.9999999999999996e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  52.15 
 
 		 168 aa  165  2.9999999999999998e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 170 aa  162  3e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  52.98 
 
 		 172 aa  154  7e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  54.25 
 
 		 172 aa  153  1e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 169 aa  152  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  50.33 
 
 		 169 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  49.67 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  51.53 
 
 		 172 aa  134  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 160 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  53.1 
 
 		 183 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  53.49 
 
 		 163 aa  130  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  55.81 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  51.7 
 
 		 169 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  52.71 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 179 aa  127  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 237 aa  127  8.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  54.69 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  52.9 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  51.54 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  48.67 
 
 		 184 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 183 aa  122  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 185 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  48.06 
 
 		 154 aa  118  4.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  46.81 
 
 		 191 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  46.81 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 146 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  53.7 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 160 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  111  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  49.64 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  45.53 
 
 		 158 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  36.6 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 147 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 157 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  35.95 
 
 		 160 aa  107  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  45.93 
 
 		 152 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 167 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  44.19 
 
 		 179 aa  104  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 		 167 aa  104  7e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 148 aa  101  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 147 aa  99  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  38.89 
 
 		 156 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 155 aa  95.1  5e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  33.62 
 
 		 151 aa  79.3  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  32.06 
 
 		 148 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3493  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 152 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00603959  normal  0.317297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0075  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3646  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 151 aa  45.4  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.571582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3754  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.852787  normal  0.231032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 186 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0769  MarR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 313 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.67 
 
 		 319 aa  45.1  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  28.57 
 
 		 319 aa  44.7  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4041  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00474505 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  38.24 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 141 aa  44.7  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2274  MarR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 167 aa  44.3  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3148  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 145 aa  44.3  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1163  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  26.53 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  25.24 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 137 aa  43.9  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 309 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1067  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  32.43 
 
 		 157 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.023606  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 146 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1863  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0934368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  29.47 
 
 		 151 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 156 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 174 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>