69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3279 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  299  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  85.42 
 
 		 147 aa  247  4e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  78.91 
 
 		 147 aa  234  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  78.32 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  73.05 
 
 		 145 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  68.92 
 
 		 158 aa  205  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  70.34 
 
 		 157 aa  202  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 146 aa  133  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  43.94 
 
 		 160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 158 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 169 aa  111  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 168 aa  105  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 152 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 167 aa  101  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 179 aa  101  4e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  42.55 
 
 		 167 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 169 aa  99.4  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 175 aa  99.4  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 169 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  34.92 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 151 aa  90.9  5e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 183 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 185 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 226 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 187 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  36.52 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  36.52 
 
 		 191 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 172 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 163 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 160 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  35.43 
 
 		 184 aa  84  7e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 172 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  39 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  36.97 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  34.17 
 
 		 148 aa  82.4  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 172 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 237 aa  80.9  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  36.94 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 173 aa  78.2  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 183 aa  62  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 181 aa  60.1  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  27.59 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.71 
 
 		 174 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0396  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 165 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>