138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3163 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  100 
 
 		 154 aa  311  1.9999999999999998e-84  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  73.57 
 
 		 163 aa  212  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  71.03 
 
 		 163 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  65.73 
 
 		 160 aa  188  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 179 aa  173  7e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 237 aa  173  7e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  58.27 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 174 aa  166  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  60 
 
 		 186 aa  157  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  59.85 
 
 		 183 aa  157  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  58.46 
 
 		 182 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 185 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 172 aa  151  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  56.15 
 
 		 169 aa  150  7e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  55.07 
 
 		 187 aa  148  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  60.87 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  60.87 
 
 		 191 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  56.15 
 
 		 183 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  54.2 
 
 		 179 aa  144  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 169 aa  142  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  53.96 
 
 		 185 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  55.38 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 226 aa  138  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  62.14 
 
 		 181 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  52.76 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 169 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  48.82 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 169 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  48.06 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  47.33 
 
 		 172 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  57.58 
 
 		 172 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  41.26 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 160 aa  93.2  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 152 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 160 aa  90.1  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  38.6 
 
 		 148 aa  89  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  45.1 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  39.47 
 
 		 160 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  43.36 
 
 		 167 aa  89  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  38.6 
 
 		 160 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  49.53 
 
 		 187 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  36.84 
 
 		 151 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.94 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  43.7 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  36.36 
 
 		 156 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  28.87 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 153 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1220  hypothetical protein  30.68 
 
 		 319 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1214  hypothetical protein  28.41 
 
 		 319 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2185  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 148 aa  47.4  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0547398  normal  0.15658 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2651  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.512568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 157 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0672  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0493  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 157 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0095  transcriptional regulator, MarR family  26.98 
 
 		 186 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5032  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 		 140 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4256  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0093  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0098  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 326 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0505  MarR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2416  MarR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 223 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.241585 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 160 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  26 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  30.95 
 
 		 174 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5097  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 151 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1523  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 154 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  30.93 
 
 		 164 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 169 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>