127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2586 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  100 
 
 
191 aa  382  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  99.48 
 
 
191 aa  379  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  88.77 
 
 
187 aa  332  3e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  73.49 
 
 
181 aa  220  8e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  65.09 
 
 
184 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  63.43 
 
 
226 aa  205  4e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  55.14 
 
 
183 aa  183  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  60.71 
 
 
169 aa  171  7.999999999999999e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  55.23 
 
 
183 aa  170  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  54.12 
 
 
182 aa  169  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  59.21 
 
 
169 aa  169  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
174 aa  166  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  57.32 
 
 
185 aa  164  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  61.43 
 
 
186 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  52.81 
 
 
179 aa  159  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
173 aa  159  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  48.88 
 
 
172 aa  158  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 
237 aa  158  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  50.3 
 
 
179 aa  157  7e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  65 
 
 
185 aa  156  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  66.67 
 
 
160 aa  154  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  63.48 
 
 
163 aa  150  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  63.48 
 
 
163 aa  149  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  60.87 
 
 
154 aa  146  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  59.05 
 
 
168 aa  135  5e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  57.41 
 
 
172 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  54.29 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  46.21 
 
 
169 aa  118  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  46.81 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
170 aa  114  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  55.1 
 
 
169 aa  114  6e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  42.97 
 
 
146 aa  106  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  54.39 
 
 
172 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
175 aa  101  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  43.44 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  41.35 
 
 
160 aa  99.4  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  39.52 
 
 
157 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 
167 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  40.38 
 
 
160 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  48.11 
 
 
152 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  47.17 
 
 
167 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  39.13 
 
 
145 aa  94.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
158 aa  95.1  6e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
160 aa  95.1  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 
160 aa  94.7  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  39.82 
 
 
148 aa  94  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
160 aa  93.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  40.4 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  40.4 
 
 
151 aa  90.5  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  38.26 
 
 
156 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  49.52 
 
 
183 aa  87.8  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  48.45 
 
 
187 aa  87  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  36.52 
 
 
148 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  38.53 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
147 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
155 aa  78.2  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
160 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
142 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 
169 aa  50.8  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0312  MarR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
146 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  29.2 
 
 
167 aa  50.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2149  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2195  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
142 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0273493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2136  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
142 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00095835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  28.12 
 
 
157 aa  48.5  0.00006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
153 aa  48.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 
140 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
176 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 
147 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 
161 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3545  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.359326  normal  0.253547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  29.58 
 
 
149 aa  46.2  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2620  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 
165 aa  45.8  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000454878  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2978  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
170 aa  45.8  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
153 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
138 aa  45.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 
159 aa  45.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  34.31 
 
 
146 aa  45.1  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
140 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
150 aa  45.1  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1307  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 
159 aa  45.1  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.702718  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  30.86 
 
 
160 aa  44.7  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2239  transcriptional regulator, MarR family  38.18 
 
 
146 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.222685  normal  0.0457312 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  31.52 
 
 
140 aa  44.7  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
157 aa  44.7  0.0009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  38.27 
 
 
174 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.04 
 
 
151 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0791  MarR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
163 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.123564  normal  0.0209412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 
169 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.27 
 
 
174 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0504  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 
154 aa  43.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.232466 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2739  transcriptional regulator, MarR family  25.44 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.340689  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
321 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>