180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4078 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  349  1e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0046  MarR family transcriptional regulator  58.43 
 
 		 187 aa  185  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.283785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2224  MarR family transcriptional regulator  50.97 
 
 		 179 aa  143  1e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0851  MarR family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 172 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0093  MarR family transcriptional regulator  48.3 
 
 		 169 aa  138  3e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.560358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3300  transcriptional regulator  48.61 
 
 		 168 aa  135  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2925  MarR family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 170 aa  134  9e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.652436 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2800  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 169 aa  127  5.0000000000000004e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1139  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 169 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.453374  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2270  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 172 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.689924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3286  transcriptional regulator, MarR family  48.72 
 
 		 183 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2787  MarR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 169 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6016  MarR family transcriptional regulator  50.86 
 
 		 226 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0276025 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7271  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 184 aa  103  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2601  MarR family transcriptional regulator  50.69 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.62528 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2557  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 183 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2586  regulatory protein MarR  44.19 
 
 		 191 aa  101  5e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3012  transcriptional regulator, MarR family  43.31 
 
 		 163 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2244  MarR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2809  transcriptional regulator, MarR family  51.55 
 
 		 191 aa  99.8  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.716089 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3279  MarR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 148 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.861844  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4070  MarR family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 181 aa  99  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.650138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2614  transcriptional regulator, MarR family  51.55 
 
 		 187 aa  99  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.68039 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1988  MarR family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 147 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.27646  hitchhiker  0.00136525 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2749  transcriptional regulator, MarR family  42.52 
 
 		 163 aa  97.8  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399599  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2894  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 160 aa  97.8  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000195714  normal  0.301041 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2441  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 160 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0799382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43140  MarR family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 158 aa  97.4  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00364645  normal  0.320995 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1738  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 169 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182936  normal  0.307444 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3619  MarR family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2582  transcriptional regulator, MarR family  37.88 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000123065  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3163  transcriptional regulator MarR family  42.55 
 
 		 154 aa  96.3  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.165579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1712  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 147 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1387  MarR family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 185 aa  95.9  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.207985  normal  0.461788 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 160 aa  95.1  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2518  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000237934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2280  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0185424  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 160 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4853  transcriptional regulator, MarR family  39.02 
 
 		 183 aa  94.7  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3138  MarR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 182 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4174  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 186 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3885  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 185 aa  94  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0480045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1470  MarR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 237 aa  94  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0772  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 146 aa  93.6  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_004310  BR1520  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 179 aa  93.2  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935208  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2519  MarR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.106367 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2672  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 145 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.273141  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2292  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 158 aa  93.2  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00249883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1840  regulatory protein, MarR  37.78 
 
 		 156 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.076526  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2141  MarR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 174 aa  90.1  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.223544  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1645  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 173 aa  88.2  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2510  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 179 aa  87.4  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2086  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 155 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.788837  hitchhiker  0.000000978102 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2652  MarR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2708  regulatory protein MarR  38.4 
 
 		 151 aa  83.6  0.000000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3510  transcriptional regulator, MarR family  46.24 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3578  transcriptional regulator, MarR family  46.24 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2241  transcriptional regulator, putative  36.8 
 
 		 148 aa  79  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3429  MarR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.063999  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4350  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.795745 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2254  MarR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 144 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  41.3 
 
 		 151 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 150 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4115  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5077  MarR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6596  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 		 140 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155903 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8206  MarR family  28.68 
 
 		 156 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1443  transcriptional regulator, TrmB  29.17 
 
 		 148 aa  47.8  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 156 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7355  transcriptional regulator, MarR family  31.2 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.238982 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6358  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  34.74 
 
 		 326 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.788549  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 159 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3485  regulatory protein MarR  28.67 
 
 		 167 aa  46.6  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3519  MarR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 163 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7503  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 156 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0350  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0304  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2905  transcriptional regulator, MarR family  22.63 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.172121 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0318  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 160 aa  45.8  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2052  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 		 180 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132777 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2205  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 153 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 147 aa  45.8  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4105  putative transcriptional regulator  36.44 
 
 		 137 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.727609  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1841  transcriptional regulator, TrmB  32.08 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.100194  normal  0.122191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7207  MarR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1834  transcriptional regulator SlyA  30.28 
 
 		 144 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.397695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0347  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0286  MarR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0364  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4956  transcriptional regulator, MarR family  35.21 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>