222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0324 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  47.51 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 193 aa  128  6e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  38.6 
 
 		 206 aa  79.3  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  32.85 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  31.67 
 
 		 174 aa  65.5  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 166 aa  64.3  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 154 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  37.21 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 143 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.43 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  28.99 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 164 aa  53.1  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 165 aa  52.4  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2637  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 152 aa  52  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00137788  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  32.5 
 
 		 143 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 157 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 149 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3643  transcriptional regulator, MarR family protein  32.33 
 
 		 163 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 145 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5709  MarR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1986  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 161 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  hitchhiker  0.000536979 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 296 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  34.88 
 
 		 146 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 141 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 146 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1910  MarR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 159 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.852737  normal  0.275089 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  35.37 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 163 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02201  hypothetical protein  35.71 
 
 		 160 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1178  MarR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 165 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  30.48 
 
 		 144 aa  46.6  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2079  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 156 aa  46.2  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.742687 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 154 aa  46.2  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  23.08 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  31.63 
 
 		 146 aa  45.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  34.57 
 
 		 139 aa  45.8  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  26.67 
 
 		 144 aa  46.2  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  27.33 
 
 		 292 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0983  MarR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 159 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 156 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5089  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 145 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.104919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3492  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 178 aa  45.8  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198314  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3189  regulatory protein, MarR  31.33 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.637369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0953  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 		 144 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4687  hypothetical protein  36.49 
 
 		 161 aa  45.4  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00000161275  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  30.69 
 
 		 154 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  45.1  0.0007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4078  MarR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.419804 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 170 aa  44.7  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 160 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 166 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 146 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2508  transcriptional regulator, MarR family  35.53 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.888447 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2312  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.986519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2233  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476984  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.14 
 
 		 144 aa  44.7  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2487  MarR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 160 aa  44.7  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.229452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  29.35 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0859  transcriptional repressor MprA  30.97 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3329  transcriptional repressor MprA  31.48 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0363  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 139 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  29.35 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  29.77 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  30.09 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  32.18 
 
 		 162 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2595  regulatory protein MarR  31.76 
 
 		 144 aa  43.9  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.660325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1793  MarR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 160 aa  44.3  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.390587  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>