177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1496 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
146 aa  297  4e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  50.68 
 
 
163 aa  142  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  30.95 
 
 
139 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
157 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 
141 aa  55.5  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  33.33 
 
 
144 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 
144 aa  54.7  0.0000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
144 aa  54.3  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  27.56 
 
 
147 aa  53.5  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 
170 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  28.78 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  30.23 
 
 
143 aa  51.2  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
165 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0124  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
148 aa  50.8  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  30.26 
 
 
169 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0149  transcription regulator protein  33.72 
 
 
157 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  0.599627 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
176 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 
145 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  34.25 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  28.23 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  25.38 
 
 
147 aa  48.9  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1722  transcriptional regulator SlyA  32.56 
 
 
145 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00118206  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  30.22 
 
 
174 aa  47.8  0.00005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
171 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0409  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
162 aa  47  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.616987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 
181 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
151 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
171 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3395  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
152 aa  46.2  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1689  transcriptional regulator SlyA  31.4 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
296 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  23.31 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  23.97 
 
 
155 aa  46.2  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5323  MarR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5412  MarR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1559  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.184935 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5702  MarR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1336  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
161 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.137049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
203 aa  45.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
144 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  23.33 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  27.78 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4459  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00777339 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.06 
 
 
146 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2759  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
178 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2676  transcriptional regulator, MarR family  26.21 
 
 
164 aa  45.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
197 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0410  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  24.78 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2229  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
154 aa  44.7  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 
193 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  32.04 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
159 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4810  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
143 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  27.12 
 
 
171 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5345  hypothetical protein  25.86 
 
 
162 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  24.6 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  26.96 
 
 
156 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  25.19 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2280  hypothetical protein  24.71 
 
 
162 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0154888  normal  0.295989 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3064  transcriptional regulator  30.23 
 
 
159 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0277554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  28.1 
 
 
181 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2811  transcriptional regulator, MarR family  27.4 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3336  MarR family transcriptional regulator  28.77 
 
 
166 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.470257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
137 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
162 aa  43.5  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1384  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
198 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  24.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2560  transcriptional regulator, MarR family  26.83 
 
 
139 aa  43.5  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.730412 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2954  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.237643  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  23.44 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 
171 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2380  transcriptional regulator, TrmB  27.78 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.110085  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1556  transcriptional regulator, MarR family  26.44 
 
 
189 aa  42.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  26.74 
 
 
158 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 
159 aa  43.5  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4296  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
161 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  24.71 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1423  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
191 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 
146 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 
140 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>