68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0020 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
156 aa  314  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0841  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
217 aa  56.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0989583  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.48 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  33.59 
 
 
206 aa  53.9  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.51 
 
 
174 aa  50.8  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 
233 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  32.32 
 
 
287 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
156 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  29.67 
 
 
166 aa  48.1  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 
193 aa  48.1  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
201 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  36.19 
 
 
161 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2789  transcriptional regulator, MarR family  27.59 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.591127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
183 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 
203 aa  46.2  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 
172 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
156 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  30.77 
 
 
292 aa  45.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  29.41 
 
 
296 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
166 aa  44.7  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 
174 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.778127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  24.19 
 
 
139 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  24.19 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
152 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  22.77 
 
 
164 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  39.71 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  23.53 
 
 
171 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
165 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  28.72 
 
 
284 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
172 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  24.79 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  28.46 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 
212 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
147 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  27.73 
 
 
164 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01757  hypothetical protein  31.68 
 
 
150 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  22.77 
 
 
141 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 
175 aa  41.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4831  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 
178 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0441993 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4966  transcriptional regulator, MarR family  29.09 
 
 
153 aa  41.2  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345847  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0968  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.798685 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1068  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
164 aa  40.8  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.388349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
154 aa  40.8  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  22.4 
 
 
157 aa  40.8  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0359  transcriptional regulator, MarR family  27.47 
 
 
141 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000165316 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  28.44 
 
 
139 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
173 aa  40.4  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  22.55 
 
 
165 aa  40.4  0.009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0804  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
140 aa  40.4  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 
165 aa  40.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2559  MarR family transcriptional regulator  24.35 
 
 
155 aa  40.4  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 
166 aa  40.4  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>