81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1495 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 166 aa  332  1e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5248  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0549534  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2690  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179811  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  27.54 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  23.85 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3655  MarR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 163 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00553213  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  27.42 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3804  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  29.13 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06990  transcriptional regulator  32.71 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.606707  normal  0.0260883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1106  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 185 aa  49.3  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.106479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  32.23 
 
 		 154 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 145 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1865  transcriptional regulator, MarR family  28.48 
 
 		 177 aa  47.8  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.281666  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  29.27 
 
 		 158 aa  47.4  0.00008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 152 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 167 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 176 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1910  MarR family transcriptional regulator  20.45 
 
 		 141 aa  45.8  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0713  transcriptional regulator, MarR family  35.83 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.174974 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 156 aa  45.1  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 148 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.35 
 
 		 140 aa  45.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  30.71 
 
 		 140 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 148 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 156 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 151 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.26 
 
 		 148 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 		 146 aa  44.3  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 142 aa  43.9  0.0009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 162 aa  43.9  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18960  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 181 aa  44.3  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0870752  normal  0.777873 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3239  transcriptional regulator, MarR family  26.01 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0448278  normal  0.196721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4161  transcriptional regulator, MarR family  24.5 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000235966  normal  0.7718 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3946  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.364439 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  34.02 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1891  MarR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.784898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1928  MarR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00769589  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  20.83 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  37.31 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 153 aa  42  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 163 aa  42  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0253  MarR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 411 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0159637  normal  0.716874 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4972  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 142 aa  42  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.229805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0419  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 189 aa  41.6  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28.75 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1624  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 270 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3392  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 270 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2918  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4913  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 152 aa  41.2  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.582328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2977  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 270 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  31.54 
 
 		 144 aa  40.8  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3581  MarR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 158 aa  40.8  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  28 
 
 		 146 aa  40.8  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 161 aa  40.8  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3671  putative transcriptional regulator  32.97 
 
 		 140 aa  40.8  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1927  transcriptional regulator, MarR family  30.63 
 
 		 187 aa  40.4  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.381478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 156 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3929  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 212 aa  40.4  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000837661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>