275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2264 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 158 aa  320  7e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23090  transcriptional regulator  35.2 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.300459  normal  0.460004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  32.03 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0741  transcriptional regulator, MarR family  31.67 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.476836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.39 
 
 		 166 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  35.87 
 
 		 145 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0880  regulatory protein, MarR  30 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2484  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.199809 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3659  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2005  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 161 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0932535  normal  0.109894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2248  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2651  transcriptional regulator, MarR family  33.03 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5000  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 168 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0749  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 		 181 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1134  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 172 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2885  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.311419  normal  0.195919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2376  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000679791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3415  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0058743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  28.07 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2156  MarR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.851939 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1679  transcriptional regulator, TrmB  24.58 
 
 		 141 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.995926  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 165 aa  48.1  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4136  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.332929  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3287  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.341859  normal  0.150177 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4230  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0771683 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 156 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  37.66 
 
 		 155 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1495  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.256865 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 143 aa  47.4  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  47.4  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3105  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 180 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.358207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 171 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4357  transcriptional regulator, MarR family  34.51 
 
 		 188 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.457368 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4126  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2612  transcriptional regulator, MarR family  27.46 
 
 		 160 aa  46.6  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.703045  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  28.93 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1851  putative transcription regulator protein  26.61 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0882274 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7572  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.334698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4301  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.554811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2777  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.975869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2485  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  30.86 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2950  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3619  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  30.86 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  22.13 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 173 aa  45.8  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2496  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.20382 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0379  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 195 aa  46.2  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2076  transcriptional regulator, MarR family  27.37 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2998  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.414929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3139  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 183 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  27.73 
 
 		 155 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  23.91 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0682  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  28.07 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1469  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3028  regulatory protein, MarR  25.83 
 
 		 172 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2425  transcriptional regulator, MarR family  28.17 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0599  transcriptional regulator, MarR family  23.46 
 
 		 174 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.219913  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2116  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 138 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5402  transcriptional regulator, TrmB  26.9 
 
 		 168 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.153615  normal  0.942445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1962  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3343  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119035  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2328  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.217001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2369  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.275534  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1236  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.322451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1849  putative transcription regulator protein  32.63 
 
 		 157 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0705598  normal  0.0434545 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2503  MarR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00391389  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3132  transcriptional regulator, MarR family  22.81 
 
 		 165 aa  44.7  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.206868  hitchhiker  0.00515248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1659  MarR family transcriptional regulator  23.73 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 151 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1207  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000193075 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 174 aa  44.7  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0233  zinc transport transcriptional repressor  32.84 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000571811  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>