36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_2427 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_2427  regulatory protein MarR  100 
 
 
151 aa  303  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.753969  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2381  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
151 aa  303  7e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1949  transcriptional regulator TcaR  63.09 
 
 
151 aa  201  4e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  33.33 
 
 
158 aa  47  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 
158 aa  46.2  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17310  regulatory protein, MarR family  22.68 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
139 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2687  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
164 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.352075 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 
149 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1846  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.123178  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 
159 aa  44.3  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1995  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 
158 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.911966  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
340 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
326 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
340 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 
159 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 
157 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4026  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
204 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
169 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
349 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  26.67 
 
 
349 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
347 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 
187 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.47 
 
 
292 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2751  transcriptional regulator, MarR family  28.83 
 
 
147 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  27 
 
 
283 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2498  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 
153 aa  40.4  0.008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.447141 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3114  hypothetical protein  40.68 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  26.47 
 
 
157 aa  40.4  0.009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4073  regulatory protein MarR  29.27 
 
 
147 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3677  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
347 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.164477 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>