81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1124 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1124  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 159 aa  307  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000288981 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2264  transcriptional regulator, MarR family  46.92 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201704  normal  0.338142 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  35.14 
 
 		 158 aa  50.8  0.000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4635  MarR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 153 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.472747  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2463  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 154 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0701  transcriptional regulator, MarR family  30.23 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.255287  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  37.8 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1895  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 143 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.423532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2196  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1702  hypothetical protein  35.23 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.588844  normal  0.186325 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2842  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1915  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0464318  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1961  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  31.87 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0933  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.611634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0411  regulatory protein, MarR  38.71 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.780525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2075  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 150 aa  45.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  40.58 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4021  transcriptional regulator, MarR family  32.14 
 
 		 166 aa  44.3  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000632832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1964  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 150 aa  44.3  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000642572  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1794  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 209 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2070  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 163 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2352  MarR family regulatory protein  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0619  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.267818  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1813  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.213004  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1055  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.435281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2670  regulatory protein MarR  30.6 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1140  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0848  MarR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0049  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.157141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1641  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.176874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 147 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0765  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00380869  hitchhiker  0.0000756657 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4833  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0190752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4139  transcriptional regulator, MarR family  29.51 
 
 		 149 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 167 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05199  transcription regulator protein  28.68 
 
 		 154 aa  42.4  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000214035  normal  0.0753058 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 181 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3441  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000000933202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4926  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000606834  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3960  transcriptional regulator, MarR family  30.86 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 163 aa  42.4  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1827  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 153 aa  42  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.331239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3223  transcriptional regulator, MarR family  32.05 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 177 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 178 aa  42  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 171 aa  42  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5106  transcriptional regulator, MarR family  32.1 
 
 		 206 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.248862  normal  0.417373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4409  transcriptional regulator, MarR family  30.68 
 
 		 161 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4886  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 203 aa  41.6  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4358  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000202613  unclonable  0.00000493526 
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 159 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4875  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 148 aa  41.6  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000623298  hitchhiker  0.0000000014051 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  28.12 
 
 		 162 aa  41.2  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  41.2  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1680  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32582  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1200  MarR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 176 aa  41.2  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 151 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  35.23 
 
 		 162 aa  40.8  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0369  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 155 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5361  MarR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  40.4  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000465127  normal  0.0688552 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8819  transcriptional regulator, MarR family  31.46 
 
 		 214 aa  40.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0213904  normal  0.276407 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>