More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_4251 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 
159 aa  311  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  48.98 
 
 
189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
178 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 
166 aa  110  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
178 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  43.67 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  40.54 
 
 
168 aa  100  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  36.11 
 
 
175 aa  95.5  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  41.41 
 
 
169 aa  85.9  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 
176 aa  80.5  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
147 aa  72.4  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  35.66 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  34.51 
 
 
170 aa  67.4  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4106  transcriptional regulator, MarR family  45 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.270127  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
179 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 
149 aa  58.2  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  34.85 
 
 
157 aa  58.5  0.00000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7275  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
151 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.430156  normal  0.0802572 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
143 aa  56.2  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 
146 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
147 aa  54.7  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
156 aa  54.7  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5651  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0956535  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0546  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  39.62 
 
 
163 aa  54.3  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0968  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0946  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000341948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1035  MarR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00309796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1113  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000014818 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
172 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 
141 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
161 aa  53.9  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  31.91 
 
 
151 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
143 aa  53.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
146 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 
146 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5446  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
219 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.668367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  42.11 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5843  MarR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
200 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
155 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7578  transcriptional regulator, MarR family  35.59 
 
 
162 aa  51.2  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2765  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 
171 aa  50.8  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  33.65 
 
 
160 aa  50.8  0.000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  33.04 
 
 
158 aa  50.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
161 aa  50.8  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
142 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  31.09 
 
 
177 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  30.3 
 
 
146 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2720  MarR family transcriptional regulator  33.66 
 
 
168 aa  50.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
139 aa  50.4  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6090  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 
155 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441137  normal  0.170401 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0629  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383532  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0573  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.588346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0719  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.5947e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0572  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000763093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0694  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00121928  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  35.04 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0705  MarR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
156 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186956  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0662  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000590636  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2325  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2773  transcriptional regulator, MarR family  46.03 
 
 
157 aa  49.3  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4644  transcriptional regulator, MarR family  27.88 
 
 
152 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000297134  unclonable  1.87332e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0730  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.378661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  40.96 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  31.31 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  37.97 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
153 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  31.86 
 
 
173 aa  48.5  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  31.2 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5385  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640191  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0893  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3532  transcription regulator MarR-like protein  29.27 
 
 
148 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  35.23 
 
 
157 aa  48.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
154 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5474  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.117895  normal  0.12821 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
155 aa  48.1  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
168 aa  48.1  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5761  MarR family transcriptional regulator  34.51 
 
 
171 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0842  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
179 aa  47.8  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.701585 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 
158 aa  47.8  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4464  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
143 aa  47.8  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0557  MarR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
152 aa  47.4  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000149259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>