More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_2688 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  330  8e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  330  8e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 169 aa  330  8e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  52.29 
 
 		 168 aa  144  4.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  54.01 
 
 		 189 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  53.42 
 
 		 162 aa  130  6.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  48.15 
 
 		 178 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 178 aa  110  8.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 175 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 147 aa  97.4  9e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 176 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  40.14 
 
 		 159 aa  94.4  6e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  39.57 
 
 		 166 aa  92  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  39.71 
 
 		 170 aa  72.4  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3015  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 173 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  27.93 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02880  transcriptional regulator  31.76 
 
 		 185 aa  53.9  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1419  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000012413  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 144 aa  53.9  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  27.5 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02870  transcriptional regulator  36.43 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3937  putative transcriptional regulator  28.3 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 145 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1040  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 156 aa  51.6  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.343203  normal  0.534786 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  29.55 
 
 		 283 aa  50.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2803  transcriptional regulator, MarR family  29.46 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 159 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0013  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 142 aa  49.7  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.75941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 151 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0843  regulatory protein MarR  30.77 
 
 		 178 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2740  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 169 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0732382 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  33 
 
 		 143 aa  49.7  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 154 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5227  MarR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.651457 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0861  MarR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  36 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 158 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  26.85 
 
 		 145 aa  48.9  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 139 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2299  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 149 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  30.56 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  38.2 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.3 
 
 		 161 aa  48.5  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0318  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 153 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1027  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 173 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 163 aa  48.9  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1577  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0137513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  26.5 
 
 		 141 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2446  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  38.2 
 
 		 157 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 149 aa  48.5  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  32.81 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1302  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 154 aa  48.9  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.475565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  48.5  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2336  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 309 aa  48.1  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0576  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0456  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 137 aa  48.1  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4115  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 160 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4191  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  47.8  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0975535  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1844  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.851332  hitchhiker  0.00903999 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1914  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 149 aa  47.8  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.202978  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 153 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5147  transcriptional regulator, TrmB  32.97 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0142176 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 152 aa  47.4  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6586  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 326 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107316  normal  0.0388033 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5740  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 326 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6104  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 326 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1028  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4150  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00563558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3838  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000189375  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  29.63 
 
 		 173 aa  47.4  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2813  MarR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 160 aa  47.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0313232  normal  0.34427 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  32.97 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1835  transcriptional regulator, TrmB  30.48 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0302316  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  22.63 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0960  MarR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 146 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.305429  normal  0.461467 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.01 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4151  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00180525  hitchhiker  0.000000202401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  31.53 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1949  MarR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0745921  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4214  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000392908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1046  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 139 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.965341  hitchhiker  0.00043703 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1964  transcriptional regulator, MarR family  32.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0924411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 		 161 aa  46.2  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00668  transcriptional regulator MarR family  31.65 
 
 		 166 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1524  MarR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 149 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>