More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4170 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  281  2.0000000000000002e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2500  MarR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 178 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.129036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2414  regulatory protein, MarR  43.33 
 
 		 176 aa  90.1  9e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2672  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2643  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2565  MarR family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 176 aa  89.4  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.137781  hitchhiker  0.0000747398 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2688  MarR family transcriptional regulator  45 
 
 		 169 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0756972  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3687  transcriptional regulator, MarR family  41.04 
 
 		 189 aa  88.2  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0250355  normal  0.0589875 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11433  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00100746  normal  0.249938 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0387  transcriptional regulator, MarR family  35.57 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6435  transcriptional regulator, MarR family  36.03 
 
 		 178 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.414411 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4251  transcriptional regulator, MarR family  36.3 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500909  normal  0.623722 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3695  transcriptional regulator, MarR family  37.24 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000171458  normal  0.0177037 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0840  regulatory protein, MarR  40 
 
 		 170 aa  70.9  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  36.15 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  37.25 
 
 		 145 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1428  MarR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.256408 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0283  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1388  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3861  transcriptional regulator, MarR family  32.11 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.640191 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  41.1 
 
 		 162 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 168 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4647  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.167247  normal  0.261087 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  39.47 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1482  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914228  normal  0.421582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1026  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  31.17 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1506  MarR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 163 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0479  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  28 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  31.91 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  47.22 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 195 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1750  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 150 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1313  regulatory protein MarR  36.89 
 
 		 165 aa  56.6  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  35.9 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  45.83 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2077  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2101  MarR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0043362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  45.83 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  45.83 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1376  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  34.45 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2372  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1860  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1470  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 150 aa  53.9  0.0000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2862  transcriptional regulator, MarR family  36.54 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.182461 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3854  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.119098 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6320  regulatory protein, MarR  34.09 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  26.92 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1008  MarR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.467576  normal  0.750434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  38.55 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1236  transcriptional regulator, TrmB  41.88 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.475364 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1575  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1949  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 166 aa  51.6  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1880  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  25.45 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3550  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.201154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1346  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0685392  normal  0.0717875 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  34.83 
 
 		 156 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  35.64 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5228  transcriptional regulator, MarR family  26.17 
 
 		 143 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0025  transcriptional regulator, MarR family  37.84 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.209709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2224  MarR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 157 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1799  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 		 136 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  39.73 
 
 		 150 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2738  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.708856 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>