245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3858 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_3858  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  296  5e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0253457  normal  0.0317444 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4148  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0630  transcriptional regulator, TrmB  30.43 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00979398  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 171 aa  57.4  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3457  MarR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.965318  hitchhiker  0.0098073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0542  regulatory protein, MarR  34.94 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.729564 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 		 144 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 168 aa  53.1  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2057  transcriptional regulator, MarR family  31.03 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.240684  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0747  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 329 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  34.72 
 
 		 178 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02539  DNA-binding transcriptional repressor of microcin B17 synthesis and multidrug efflux  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1000  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.944613  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3192  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.885571  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02504  hypothetical protein  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2806  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00193858  hitchhiker  0.00916443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2820  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1023  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 176 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0388425 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3928  transcriptional repressor MprA  28.16 
 
 		 176 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.500125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2619  transcriptional regulator, MarR family  26.36 
 
 		 167 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1081  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 166 aa  49.7  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00103663 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 183 aa  48.9  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2996  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026916 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3337  transcriptional repressor MprA  35.94 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3119  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0399537 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3458  transcriptional repressor MprA  35.94 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3200  transcriptional repressor MprA  35.94 
 
 		 170 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2930  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2961  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0125645 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3013  transcriptional repressor MprA  27.72 
 
 		 176 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073704 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0201  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000347267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5805  transcriptional regulator, MarR family  32.95 
 
 		 164 aa  48.5  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3233  MarR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.550723  normal  0.0343876 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1151  transcriptional regulator, TrmB  24.72 
 
 		 162 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.119377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1790  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.167735  hitchhiker  0.000000130168 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  22.06 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 171 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0119  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 178 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 144 aa  48.1  0.00004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  27.43 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3741  transcriptional repressor MprA  33.82 
 
 		 173 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.18911 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0897  MarR family transcriptional regulator  27 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0270  MarR family transcriptional regulator  23.57 
 
 		 142 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1849  transcriptional regulator, MarR family  28.04 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000744389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01882  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  26.12 
 
 		 166 aa  47  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2967  transcriptional repressor MprA  32.35 
 
 		 176 aa  47.4  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.771263  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0097  transcriptional regulator, MarR family  24.8 
 
 		 152 aa  47  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3662  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2960  MarR family transcriptional regulator  21.99 
 
 		 180 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.778085  normal  0.726943 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4499  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.148368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3865  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0792032  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3063  transcriptional regulator, MarR family  27.34 
 
 		 168 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 144 aa  46.6  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3835  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000426695  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3762  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.425599  hitchhiker  0.00135953 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1939  MarR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 162 aa  46.2  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737165  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0719  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0806783  normal  0.0372337 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3162  transcriptional repressor MprA  26.73 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0691  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 142 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.72 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2639  transcriptional regulator, MarR family  19.29 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  24.76 
 
 		 148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 151 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2842  MarR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003137  transcriptional regulator MarR family  25 
 
 		 167 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0057882  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0847  transcriptional regulator, MarR family  24.27 
 
 		 147 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2059  regulatory protein, MarR  25.21 
 
 		 166 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0666418  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 138 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  28.17 
 
 		 163 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2807  transcriptional regulator, MarR family  28.72 
 
 		 176 aa  45.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.613764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  27.66 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 		 161 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  31.43 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>