More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4492 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 193 aa  374  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  89.74 
 
 		 195 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  82.28 
 
 		 219 aa  238  5e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  81.65 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  81.65 
 
 		 213 aa  235  4e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  79.73 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  51.23 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  35.92 
 
 		 146 aa  94.4  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 163 aa  91.7  7e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.42 
 
 		 153 aa  91.3  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 166 aa  85.5  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  37.76 
 
 		 170 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  37.06 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 167 aa  79  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  40.15 
 
 		 180 aa  75.5  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 183 aa  69.3  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.79 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4874  regulatory protein, MarR  28.47 
 
 		 161 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0298906  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.01 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4170  MarR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 147 aa  57.4  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.282675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 139 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  29.46 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  25.4 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  40.4 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  21.58 
 
 		 165 aa  55.1  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  29.05 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1346  transcriptional regulator  25.45 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.564639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 147 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 143 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 165 aa  54.3  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  28.86 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  45.59 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  29.25 
 
 		 159 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.08 
 
 		 324 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 160 aa  53.1  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.38 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 158 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4592  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00218111 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5222  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 167 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  31.65 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 146 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2897  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 141 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 159 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  39.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 142 aa  52.4  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5637  MarR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 147 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.701492  normal  0.0148213 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 157 aa  52.4  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1531  transcriptional regulator, TrmB  34.82 
 
 		 141 aa  52.4  0.000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.02316  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  28.36 
 
 		 147 aa  52  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5466  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.17419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2814  MarR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.388946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 141 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4917  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 167 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.36194  normal  0.834518 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 147 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 142 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3216  MarR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 174 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0422342 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2247  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 143 aa  51.6  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.078909 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1723  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 171 aa  51.2  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 146 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3416  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.765754  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3070  transcriptional regulator, MarR family  33.86 
 
 		 162 aa  51.2  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 164 aa  50.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  31.87 
 
 		 139 aa  50.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 160 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  33.68 
 
 		 161 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1638  transcriptional regulator, MarR family  26.76 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00207859 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0789  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4880  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 157 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.368926  hitchhiker  0.00140951 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 155 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 143 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1206  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>