More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0560 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0560  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 162 aa  318  1.9999999999999998e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0517108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1140  regulatory protein MarR  38.46 
 
 		 144 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3989  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.552919  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4156  MarR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 150 aa  87.8  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.331896  normal  0.584748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  42.2 
 
 		 158 aa  87.8  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7614  transcriptional regulator, MarR family  36.42 
 
 		 157 aa  84.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.647741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1972  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 		 159 aa  84.3  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.276082  normal  0.475947 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5066  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 149 aa  79.7  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.850935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6813  hypothetical protein  34.72 
 
 		 152 aa  78.2  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.611714  normal  0.242939 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0289  transcriptional regulator, MarR family  36.22 
 
 		 158 aa  74.7  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.660944 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2538  transcriptional regulator, MarR family  39.69 
 
 		 154 aa  72.4  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4525  MarR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209955  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1929  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1911  transcriptional regulator, MarR family  36.59 
 
 		 164 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1208  transcriptional regulator, MarR family  32.86 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00251951  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1950  transcriptional regulator, MarR family  34.13 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.146852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1312  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 164 aa  64.3  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3073  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1937  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0024671  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1286  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.204943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6943  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4592  transcriptional regulator, MarR family  42.36 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0409464  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2033  MarR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 303 aa  62  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2129  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0697643  normal  0.94503 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 154 aa  62.4  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 190 aa  61.2  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 161 aa  61.2  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0696  transcriptional regulator, MarR family  41.49 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.218758  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2317  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 150 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6941  transcriptional regulator, MarR family  38.69 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.853349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2113  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.553961 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3450  MarR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 155 aa  58.2  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3114  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000547755 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  33.88 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1315  MarR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.146285  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2432  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6047  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4219  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.260034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  33.1 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0259  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 164 aa  57  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8631  Transcriptional regulators-like protein  33.57 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.6 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2273  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.123846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  33.87 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  33.87 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1714  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3541  transcriptional regulator, Mar family  35.48 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3825  MarR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  32.23 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  33.06 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3320  hypothetical protein  32.84 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0293206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 151 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  38.38 
 
 		 296 aa  54.3  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43770  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  35 
 
 		 159 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 148 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  29.01 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  31.97 
 
 		 208 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  31.85 
 
 		 142 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0758  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.575912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3265  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 326 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3368  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 165 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>