More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10897 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 
143 aa  275  2e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  71.13 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  71.13 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  71.13 
 
 
143 aa  194  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  57.66 
 
 
151 aa  151  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1252  regulatory protein MarR  53.24 
 
 
146 aa  132  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.906766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  49.62 
 
 
148 aa  126  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  50 
 
 
144 aa  125  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0818  transcriptional regulator, MarR family  51.15 
 
 
144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  47.76 
 
 
149 aa  123  9e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  53.79 
 
 
141 aa  123  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  52.27 
 
 
151 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  52.99 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
144 aa  117  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 
162 aa  114  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  45.93 
 
 
163 aa  111  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  48.48 
 
 
158 aa  110  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  45.19 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  45.31 
 
 
152 aa  107  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  46.72 
 
 
147 aa  107  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  42.97 
 
 
143 aa  104  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3927  regulatory protein, MarR  48.18 
 
 
156 aa  105  3e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8888  hypothetical protein  45.99 
 
 
153 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0109  MarR family transcriptional regulator  48.44 
 
 
139 aa  97.1  7e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  41.6 
 
 
150 aa  95.5  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30810  transcriptional regulator  40.31 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  44.07 
 
 
145 aa  92.8  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  39.72 
 
 
157 aa  89.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13520  transcriptional regulator  38.93 
 
 
163 aa  84  7e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.219319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  42.31 
 
 
139 aa  84  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
151 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
151 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
150 aa  81.6  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 
147 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
151 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4805  transcriptional regulator, MarR family  43.17 
 
 
163 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
149 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
150 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
162 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
159 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  38.94 
 
 
150 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.59 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  37.4 
 
 
140 aa  69.3  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  34.53 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
156 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  34.33 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
144 aa  67.8  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  39.55 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  37.6 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1608  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0698671 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  39.34 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4830  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
157 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.538912  normal  0.641937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  36.94 
 
 
164 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4190  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 
147 aa  62.8  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.724781  normal  0.244242 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  34.09 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
147 aa  61.2  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.08 
 
 
149 aa  60.8  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3538  regulatory protein MarR  35.71 
 
 
153 aa  59.7  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.671328  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
146 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
163 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  40.24 
 
 
175 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  34.68 
 
 
156 aa  57.8  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  33.08 
 
 
161 aa  57.4  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1259  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
150 aa  57  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.518732 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6049  MarR family transcriptional regulator  38.83 
 
 
146 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0181443  normal  0.76378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4316  MarR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1677  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3432  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.262117  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1651  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.902908  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1702  MarR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
172 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00165311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3495  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.144178  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1269  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3443  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
155 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.361785 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.06 
 
 
180 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
150 aa  54.3  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0628  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.382396  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0537  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 
172 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.075487  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  31.13 
 
 
163 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>