More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1375 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 163 aa  325  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 166 aa  191  4e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 167 aa  113  8.999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  43.28 
 
 		 180 aa  111  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  40.71 
 
 		 170 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  41.41 
 
 		 170 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 163 aa  95.9  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0768  transcriptional regulator, MarR family  41.29 
 
 		 219 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.012772 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0844  regulatory protein MarR  40 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0324688  normal  0.429878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  40.54 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0803  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 213 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.179436 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4560  MarR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 195 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000343036 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4492  transcriptional regulator, MarR family  40.6 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.57372  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0863  transcriptional regulator, TrmB  42.74 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0029609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  35.54 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  30.91 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4555  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334202  normal  0.226975 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4468  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4851  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.228768  normal  0.062609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.01 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 160 aa  60.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 143 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 164 aa  58.9  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 139 aa  58.5  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.41 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  28.18 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.43 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  28.18 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 141 aa  57.4  0.00000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0158  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 144 aa  57  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 139 aa  57  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  31.94 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  24.09 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 144 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  24.09 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  41.98 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  24.09 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  28 
 
 		 169 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3252  transcriptional regulator, MarR family protein  28 
 
 		 161 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  29.82 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  28.83 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  25.95 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  29.08 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  27.73 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  22.7 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 168 aa  53.9  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  30.77 
 
 		 152 aa  53.9  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 164 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 205 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  26.03 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  22.86 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  35.53 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 314 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 191 aa  52  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  24.42 
 
 		 146 aa  52  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  24.42 
 
 		 144 aa  52  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3482  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 171 aa  52  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2954  MarR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 155 aa  52  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  25.95 
 
 		 152 aa  52  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 169 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 154 aa  51.6  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  24.42 
 
 		 146 aa  51.6  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 140 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 156 aa  51.2  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  31.36 
 
 		 174 aa  51.6  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 142 aa  51.6  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 147 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 160 aa  51.6  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>