147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1636 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1636  transcriptional regulator  100 
 
 		 152 aa  304  2.0000000000000002e-82  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  57.43 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3251  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3030  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.286737  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2951  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3263  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3281  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 		 150 aa  163  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3274  MarR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.154941  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1999  transcriptional regulator, MarR family  54.05 
 
 		 150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3730  transcriptional regulator, MarR family  53.33 
 
 		 151 aa  150  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  26.36 
 
 		 151 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0669  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.263204  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6873  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 159 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 169 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 163 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26 
 
 		 177 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 149 aa  51.2  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  28.05 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32610  transcriptional regulator  24.22 
 
 		 166 aa  51.2  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0590673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  27.52 
 
 		 153 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5689  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0868849  normal  0.757777 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  29.06 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  26.32 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  27.78 
 
 		 176 aa  49.3  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  29.47 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 292 aa  48.5  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 161 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 148 aa  48.5  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 161 aa  48.1  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0891  transcriptional repressor MprA  29.07 
 
 		 170 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00705044  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3234  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 140 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0823  transcriptional regulator, MarR family  24.75 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0620  MarR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 168 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1742  MarR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0578  transcriptional regulator, MarR family protein  29.49 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  24.06 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 159 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 171 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0706  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.928225  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0625  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.427597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0569  transcriptional regulator, MarR family  22.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3487  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544367  normal  0.213963 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3772  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0540  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0564  MarR family transcriptional regulator  22.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 166 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4043  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 326 aa  45.1  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.529285 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3765  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 142 aa  45.1  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.81029  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4605  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  44.7  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3758  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715353  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 156 aa  44.7  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4501  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 336 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 161 aa  43.9  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  20.8 
 
 		 168 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  30.56 
 
 		 158 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 158 aa  43.9  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5793  transcriptional regulator, MarR family  24.77 
 
 		 186 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 175 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3441  MarR family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0331  hypothetical protein  24.14 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  27.36 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5827  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 176 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000586451 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4630  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.7 
 
 		 161 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  29.47 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3714  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2929  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 315 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0675184  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  21.43 
 
 		 139 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3787  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.557158  normal  0.185703 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3727  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  35.44 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  25 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6607  MarR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 329 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.542838  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>