209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1082 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1082  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  278  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000105511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  53.28 
 
 		 139 aa  145  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0382  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0392  regulatory protein MarR  35.56 
 
 		 139 aa  94  6e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3401  transcriptional regulator, MarR family  34.85 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11880  transcriptional regulator  29.55 
 
 		 147 aa  72.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0017  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1496  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000613128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  24.44 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 191 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0037  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  25.95 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1782  MarR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 163 aa  57  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  25.74 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1259  hypothetical protein  29.91 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  31.3 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5361  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 183 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0440  transcriptional regulator, MarR family  26.79 
 
 		 146 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  32.26 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 154 aa  50.8  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 159 aa  50.8  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 141 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2881  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1334  transcriptional regulator, MarR family  32.71 
 
 		 148 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9024  Transcriptional regulators-like protein  26.36 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 156 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  32.47 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  26.13 
 
 		 174 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1847  MarR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 178 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.603807  normal  0.333569 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0732  MarR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0109  transcriptional regulator, MarR family  24.32 
 
 		 141 aa  48.1  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0942  MarR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.388439 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1001  transcriptional regulator, MarR family  24.17 
 
 		 167 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.106704  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0987  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000387404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  29.69 
 
 		 142 aa  47.8  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 166 aa  47.4  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  25.38 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 169 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  24.62 
 
 		 144 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 139 aa  47  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 167 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  24.29 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1561  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.175593  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  23.01 
 
 		 139 aa  47  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0083  MarR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 176 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.645413  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2663  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.6589700000000003e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2043  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.756399  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0722  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  32.26 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0600  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.582812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3065  transcriptional regulator, MarR family  29.91 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0826002 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0511  transcriptional regulator  26.42 
 
 		 143 aa  45.4  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2193  MarR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 212 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.255124  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2106  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.187591  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  21.64 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4176  transcriptional regulator, MarR family  23.08 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.462707 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  26.8 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1150  Transcriptional regulators-like protein  24.35 
 
 		 168 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2400  transcriptional regulator, MarR family  32.26 
 
 		 137 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  23.31 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 165 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2243  transcriptional regulator, MarR family  21.74 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.355574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  27.41 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  23.01 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  23.42 
 
 		 159 aa  45.1  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1163  MarR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 159 aa  45.1  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.404359  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  20.61 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0660  MarR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.327844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  26.85 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2769  regulatory protein, MarR  29.81 
 
 		 174 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2617  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 160 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.279233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 146 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  26.85 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5147  transcriptional regulator, MarR family  24.44 
 
 		 146 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  26.85 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  26.85 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  26.85 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>