More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3382 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  63.7 
 
 		 138 aa  176  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  62.96 
 
 		 138 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  57.14 
 
 		 149 aa  173  8e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  40.3 
 
 		 152 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1741  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15661  normal  0.360126 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  42.4 
 
 		 152 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  36.09 
 
 		 139 aa  80.5  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  37.5 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  43 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  37.3 
 
 		 149 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  32.87 
 
 		 138 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  27.94 
 
 		 142 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  73.2  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  32.82 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 154 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.73 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  39.18 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  26.72 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.9 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2856  MarR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 201 aa  67.8  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.843332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  67  0.00000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  32.04 
 
 		 145 aa  66.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 139 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2546  MarR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  43.53 
 
 		 142 aa  62  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  62  0.000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 142 aa  61.6  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  36 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1283  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.16464  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  28.81 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1494  MarR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00612694  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 150 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  30.25 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  31 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2174  regulatory protein MarR  32 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.363681 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2452  transcriptional regulator, MarR family  29.6 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.126734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  35.58 
 
 		 151 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0409  MarR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.33 
 
 		 180 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1907  MarR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 193 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.75839 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0628  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 144 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 141 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2105  MarR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000763901  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  38.16 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  26.57 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2958  transcriptional regulator, MarR family  32.61 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000649784  normal  0.827828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  26.85 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2629  MarR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 160 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.8863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>