More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4775 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 164 aa  329  8e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1821  transcription regulator protein  33.08 
 
 		 147 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.676106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1331  MarR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.524109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2878  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 161 aa  72.4  0.000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.149923 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 141 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3239  transcriptional regulatory protein  33.82 
 
 		 160 aa  70.9  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.616739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  31.33 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2214  MarR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.514813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3893  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.811485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 152 aa  67.4  0.00000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0741  MarR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 157 aa  66.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0651  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1882  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.64976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 141 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0747  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.618576 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  28.15 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  31.51 
 
 		 148 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 142 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0938  MarR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 165 aa  62  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00631452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1341  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3216  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  27.54 
 
 		 147 aa  61.2  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3159  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 164 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2980  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134372  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2920  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1041  regulatory protein, MarR  26.67 
 
 		 165 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.610773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3249  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.490647  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3228  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2992  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3220  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5961  transcriptional regulator, MarR family  37.63 
 
 		 142 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3945  MarR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.341405 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 163 aa  58.9  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3117  MarR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0362  MarR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1801  regulatory protein, MarR  33.55 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.458466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003355  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00113981  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  32.56 
 
 		 162 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1670  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.428433  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2185  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3507  MarR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0146152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1843  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4010  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 168 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.898778  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3566  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 164 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4278  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00638818  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2891  transcriptional regulator, MarR family  25.55 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.749218  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  28.28 
 
 		 149 aa  55.5  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7584  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.380555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1513  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0139337  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5307  transcriptional regulator, MarR family  30.3 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3813  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.363185  normal  0.48019 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1903  transcriptional regulator, MarR family  32.08 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0221368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3618  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3470  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.344225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 160 aa  54.3  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4406  transcriptional regulator, MarR family  29.75 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3588  homoprotocatechuate degradation transcriptional regulator HpaR  29.59 
 
 		 164 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561471  normal  0.732711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1042  transcriptional regulator, MarR family  29.85 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01430  transcriptional regulator  34.02 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  37.93 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  26.92 
 
 		 142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5723  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1709  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592382  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 143 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  31.71 
 
 		 148 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1724  transcriptional regulator, MarR family  35.14 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.118404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3612  MarR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 171 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.463026  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  28.7 
 
 		 176 aa  53.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1625  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1122  MarR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 151 aa  53.1  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0246  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 		 144 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1953  transcriptional regulator, MarR family  26.12 
 
 		 154 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0121252 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0728  MarR/EmrR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 168 aa  52.4  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4052  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 157 aa  52.4  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0791  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0914  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.423224  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3546  MarR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212621  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  31.79 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2454  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0859924 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04217  transcriptional regulator MarR/emrR family  24.82 
 
 		 149 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3500  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 164 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>