More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1210 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  100 
 
 		 139 aa  281  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  98.56 
 
 		 139 aa  277  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  38.81 
 
 		 149 aa  85.1  3e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  38.52 
 
 		 138 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 138 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  43.75 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  35.07 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 147 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 144 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  31.3 
 
 		 153 aa  73.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 150 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1975  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 155 aa  70.5  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0153804  normal  0.896313 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  30.58 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 148 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 147 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 143 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  36.21 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 169 aa  68.6  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  36.28 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  30.66 
 
 		 158 aa  67  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 150 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 		 146 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  34.21 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 154 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2382  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 145 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00066282  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2666  transcriptional regulator SlyA  30.83 
 
 		 145 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0001523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  34.65 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  29.69 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  26.81 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1614  transcriptional regulator SlyA  37.37 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.550286 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1730  transcriptional regulator SlyA  37.37 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00443681  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1899  transcriptional regulator SlyA  37.37 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0947823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 174 aa  64.7  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2781  transcriptional regulator, MarR family  27.82 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0129977 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.91 
 
 		 180 aa  64.3  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  35.59 
 
 		 149 aa  64.3  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 141 aa  64.3  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  27.19 
 
 		 151 aa  63.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1651  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.20136e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 136 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  40 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0860  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 151 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00194997  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 168 aa  63.5  0.0000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3308  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4897  transcriptional regulator, MarR family  30.84 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3099  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.634884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3085  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.729277  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1928  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.428879 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2996  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000177119  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3321  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3344  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3314  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1245  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 		 176 aa  63.5  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.868936  normal  0.145982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3304  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 		 138 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.779081  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1541  transcriptional regulator SlyA  36.36 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2898  transcriptional regulator, TrmB  33.33 
 
 		 155 aa  62.4  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.334267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 191 aa  62  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.06 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 159 aa  62  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1554  transcriptional regulator SlyA  36.36 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  36.36 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 150 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1557  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 144 aa  62  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2069  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.180128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 146 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1998  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000396376  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3745  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00569269  normal  0.244623 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1987  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.225625  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01602  hypothetical protein  35.04 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1718  transcriptional regulator SlyA  35.04 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.485306  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 142 aa  61.2  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  33.63 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3012  MarR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.135712  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>