More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2265 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2265  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 296 aa  569  1e-161  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22260  transcriptional regulator  45.6 
 
 		 206 aa  95.5  9e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.348983 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1920  transcriptional regulator, MarR family  37.32 
 
 		 233 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  34.92 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 145 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0742  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3151  transcriptional regulator, MarR family  37.78 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355975  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6338  transcriptional regulator, MarR family  34.38 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160711 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  67.4  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0324  transcriptional regulator, MarR family  37.01 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 159 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 146 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  38 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  30.2 
 
 		 154 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 162 aa  61.6  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1458  regulatory protein  36.45 
 
 		 149 aa  60.1  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3289  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.131138 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  30.22 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0325  MarR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 150 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0883  transcriptional regulator, MarR family  31.5 
 
 		 154 aa  59.3  0.00000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.736004  normal  0.090725 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1453  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  30.7 
 
 		 139 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  32.2 
 
 		 149 aa  58.5  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1653  MarR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 177 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.959419  normal  0.745484 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1580  MarR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 177 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0153854  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1807  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 		 163 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 146 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  29.82 
 
 		 139 aa  57.4  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  57  0.0000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0020  transcriptional regulator, MarR family  29.66 
 
 		 156 aa  57  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.275315  normal  0.608175 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 		 143 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1599  MarR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.276188  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  36.79 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0776  transcriptional regulator, MarR family  38.82 
 
 		 187 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.216692  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 160 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 138 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  35.88 
 
 		 324 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2845  MarR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 166 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 165 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0453  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 166 aa  55.5  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000992665  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  29.84 
 
 		 141 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  33.04 
 
 		 180 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3152  hypothetical protein  25.33 
 
 		 284 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 141 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2391  MarR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 164 aa  54.7  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.631724  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 174 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  37.39 
 
 		 153 aa  54.3  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 163 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1375  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 163 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1816  MarR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 160 aa  53.9  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.927572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 147 aa  54.3  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1130  MarR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 148 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04197  hypothetical protein  30.09 
 
 		 165 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  31.3 
 
 		 162 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 161 aa  53.5  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4603  transcriptional regulator, MarR family  26.24 
 
 		 150 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.221434  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1620  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 140 aa  53.1  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664296  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3626  regulatory protein, MarR  34.17 
 
 		 157 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000021465  normal  0.0936579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 156 aa  53.1  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3139  putative transcription regulator protein  30.39 
 
 		 159 aa  52.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 142 aa  52.8  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1133  regulatory protein MarR  30.83 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00402057  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 141 aa  52.8  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 146 aa  52.8  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1435  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 151 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209441 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1110  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 139 aa  52.8  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0273499  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04231  Homoprotocatechuate degradative operon repressor  30.09 
 
 		 148 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 144 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4585  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.09 
 
 		 148 aa  52.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4891  homoprotocatechuate degradation operon regulator, HpaR  30.09 
 
 		 148 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 157 aa  52.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 147 aa  52.4  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0855  transcriptional regulator, MarR family  38.89 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4554  transcriptional regulator, MarR family  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4364  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4200  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4211  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  31.73 
 
 		 162 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2231  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 150 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.106154  normal  0.474897 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4699  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4993  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 169 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1573  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 139 aa  52  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0165267  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0635  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 139 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.625511  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4558  MarR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 150 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3738  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000310515  hitchhiker  0.00461263 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>