More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0096 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 141 aa  286  7e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 154 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  46.67 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  39.23 
 
 		 160 aa  94  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 159 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 153 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 182 aa  79  0.00000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  32.09 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 159 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 155 aa  73.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  36.3 
 
 		 149 aa  73.2  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 146 aa  72  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 156 aa  70.1  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  29.41 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4933  MarR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 157 aa  67  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5052  MarR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  34.82 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3617  transcriptional regulator, MarR family  32.52 
 
 		 150 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.821242  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 146 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 160 aa  63.9  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  36.56 
 
 		 159 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.05 
 
 		 140 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0200  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3377  regulatory protein, MarR  37.5 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0974589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6147  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.676081  normal  0.847722 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0196  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.149236  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0175  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 150 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1876  transcriptional regulator SlyA  32.58 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000000116497  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2560  transcriptional regulator SlyA  32.58 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1767  transcriptional regulator SlyA  32.58 
 
 		 143 aa  60.1  0.000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000697661  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5772  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.94508 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6016  MarR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0683  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4794  putative MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.717119  normal  0.755619 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5812  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.697265  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6176  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.714929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  29.93 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  31.82 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6622  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 158 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0170  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7721  MarR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0515  transcriptional regulator, MarR family  32.41 
 
 		 163 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.628679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 157 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3581  MarR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6656  MarR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03534  transcriptional regulator for cryptic hemolysin  33.04 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1216  hypothetical protein  32.14 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0482  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537817  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  34.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 161 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1210  hypothetical protein  32.53 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  30.56 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 156 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 352 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2214  transcriptional regulator SlyA  32.22 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.559997  hitchhiker  0.000464724 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1519  transcriptional regulator, MarR family  35.9 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.513004  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 143 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 191 aa  54.3  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1729  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 177 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.892869  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0083  transcriptional regulator SlyA  31.46 
 
 		 144 aa  54.3  0.0000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.404027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>