More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3061 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 159 aa  315  2e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 153 aa  107  6e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1989  MarR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 164 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.7942 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0096  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 144 aa  77  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  36.76 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2258  MarR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 155 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.148664  normal  0.143759 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 160 aa  72.8  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 174 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 155 aa  70.9  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  35.09 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 146 aa  64.7  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  29.37 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1789  putative transcriptional regulator  38.61 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20850  MarR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4515  MarR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 145 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.934068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7636  MarR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 159 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 159 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1008  transcriptional regulator, MarR family  29.2 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.167585  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4021  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.021519 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1396  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 145 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1645  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.150607  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2913  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1469  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 144 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184271 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3737  regulatory protein, MarR  37.62 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.366539  normal  0.0258471 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2395  transcriptional regulator SlyA  31.25 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.08 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1511  MarR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 159 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  35.05 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  29.55 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1367  transcriptional regulator, MarR family  30.65 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000123372  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2161  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0866  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2712  MarR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 147 aa  55.1  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0271862 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  32.94 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  32.67 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  32.67 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1637  transcriptional regulator, MarR family  26.32 
 
 		 158 aa  53.9  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.615997 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  31.68 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32790  Transcriptional regulator MarR family protein  34.82 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1558  transcriptional regulator, MarR family  32.38 
 
 		 149 aa  53.9  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 191 aa  52.4  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1805  transcriptional regulator SlyA  35.85 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.734426  hitchhiker  0.00344529 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 167 aa  52.8  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2297  regulatory protein, MarR  31.18 
 
 		 160 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3170  transcriptional regulator, MarR family  30.07 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.11515  hitchhiker  0.0000000757485 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0619  MarR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 156 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 149 aa  52.4  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3371  regulatory protein, MarR  39.19 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2070  transcriptional regulator MarR  33.9 
 
 		 151 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.317078 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5688  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.153344  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 145 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1876  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 		 151 aa  52.4  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2359  transcriptional regulator, MarR family  33.61 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2761  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  37.84 
 
 		 305 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.690582  normal  0.688792 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 150 aa  51.6  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 159 aa  52  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>