250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2889 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 167 aa  342  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  30.41 
 
 		 148 aa  60.8  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.24 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0735  MarR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.711731  normal  0.77844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  27.52 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3300  transcriptional regulator, MarR family  27.14 
 
 		 147 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 174 aa  57.4  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1921  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.124747  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0659  MarR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.51685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0802  MarR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0707582  normal  0.338446 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0661  transcriptional regulator, MarR family  33.01 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3704  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 145 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 142 aa  52.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1625  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 156 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 159 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  31.73 
 
 		 146 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 154 aa  52.4  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4102  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4422  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 138 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3794  transcriptional regulator  32.06 
 
 		 149 aa  52  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5487  Transcriptional regulators-like protein  34.91 
 
 		 169 aa  51.2  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.303163  normal  0.0138039 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2101  MarR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 142 aa  51.2  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.741541 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 161 aa  51.2  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4464  MarR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 146 aa  51.2  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0499169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  33.85 
 
 		 149 aa  50.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 141 aa  50.8  0.000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02788  putative transcriptional regulator (MarR family) protein  29.35 
 
 		 109 aa  50.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4631  transcriptional regulator, MarR family  45.76 
 
 		 162 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0697845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4238  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0637  transcriptional regulator, MarR family  33.73 
 
 		 170 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4128  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565602  normal  0.462864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2226  MarR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 144 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.971671 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1107  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1111  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3391  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_004310  BR1796  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.630858  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1726  transcriptional regulator, MarR family  41.67 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1858  MarR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 168 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  21.8 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3246  MarR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1907  MarR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 146 aa  48.5  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.663626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1032  transcriptional regulator, MarR family  33.71 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1873  MarR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 142 aa  48.5  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.924998 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0910  MarR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 189 aa  48.5  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.371157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3846  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.530483 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4923  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 		 138 aa  48.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2388  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 168 aa  48.1  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  48.1  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 160 aa  48.5  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3334  transcriptional regulator, TrmB  25.37 
 
 		 151 aa  48.1  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2236  MarR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 155 aa  48.1  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.443536  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  26.67 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 145 aa  47.8  0.00008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0023  transcriptional regulator, TrmB  37.97 
 
 		 151 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0432  MarR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 173 aa  47.8  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3793  transcriptional regulator MarR family  27.27 
 
 		 180 aa  47.4  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0743996  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0517  transcriptional regulator, MarR family  26.28 
 
 		 161 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3538  MarR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2225  MarR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 162 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.582013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3234  transcriptional regulator, MarR family  40.91 
 
 		 154 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.255403  hitchhiker  0.00212329 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1374  MarR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0911  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.369038 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1908  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 163 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02203  transcription regulator transcription regulator protein  36.36 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0707  regulatory protein MarR  29.09 
 
 		 151 aa  46.2  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0488  MarR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.123923  normal  0.124611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1814  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.571932 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  22.96 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1297  transcriptional regulator  27.78 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00292407  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  38.81 
 
 		 146 aa  46.6  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1889  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 182 aa  45.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3804  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.279751  hitchhiker  0.00000113316 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  29.81 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4167  MarR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1073  MarR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 152 aa  45.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.136141  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  27.19 
 
 		 145 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  38.27 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 149 aa  45.8  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6224  transcriptional regulator, MarR family  26.42 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6524  transcriptional regulator, MarR family  24.82 
 
 		 146 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00893581  normal  0.0928109 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 		 157 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2746  MarR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.477322  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  40.58 
 
 		 157 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0337  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 191 aa  45.1  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.732334  normal  0.045327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  25.89 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>