More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1192 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1192  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 143 aa  287  3e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.428453  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0135  MarR family transcriptional regulator  64.41 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0150  MarR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 154 aa  89  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0208553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0640  transcriptional regulator, MarR family  36.13 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0410706  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 165 aa  67.8  0.00000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 157 aa  60.8  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 165 aa  60.5  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2703  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  27.62 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 167 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1954  MarR family transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0164  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 152 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.906784 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1555  MarR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 157 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.709951  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2688  hypothetical protein  39.13 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000000000464227  normal  0.10076 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 205 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0105  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.983875 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.93 
 
 		 177 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4242  MarR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 172 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.594533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1718  transcriptional regulator, MarR family  30.51 
 
 		 159 aa  56.6  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 156 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0604  transcriptional regulator, MarR family  32.99 
 
 		 146 aa  56.2  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.21182  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1655  transcriptional regulator, MarR family  27.03 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 159 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1449  MarR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  28.57 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  23.93 
 
 		 143 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3360  transcriptional regulator, MarR family  29.73 
 
 		 151 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2628  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00233343  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3661  MarR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 172 aa  55.1  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.185456  normal  0.0917972 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1607  transcriptional regulator, MarR family  29.23 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3070  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.739807 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3125  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0371002 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3041  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2006  regulatory protein, MarR  32.5 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3229  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.880017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3109  transcriptional regulator HosA  30.39 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2214  MarR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.693341 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  29.06 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5772  MarR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1739  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2289  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.34986 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2133  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0360  MarR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2632  MarR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.256033  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1379  transcriptional regulator, MarR family  30.09 
 
 		 149 aa  53.5  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.92932 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3252  transcriptional regulator, MarR family  29.9 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1441  MarR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 147 aa  52.8  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.256486  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 158 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1059  transcriptional regulator, TrmB  24.75 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0495893  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2838  transcriptional regulator, MarR family  26.85 
 
 		 140 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1595  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.156116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1670  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529848 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0962  MarR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 165 aa  52.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.100112  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2587  MarR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.443857  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2478  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.795114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 140 aa  52  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0013  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 154 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000751297  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2795  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2240  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.26 
 
 		 162 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2022  transcriptional regulator, MarR family  28.16 
 
 		 156 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.216819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3305  MarR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1895  MarR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.409274  decreased coverage  0.00000000000000377127 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1866  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0339276  hitchhiker  0.000000667119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0158  transcriptional regulator, MarR family  29.21 
 
 		 152 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0107221 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1199  regulatory protein MarR  29.46 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1552  MarR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0111  transcriptional regulator, MarR family  32.98 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3261  MarR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4187  MarR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2598  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0212362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2244  transcriptional regulator, MarR family  29.79 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.434115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2485  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2640  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 		 154 aa  52  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0617  MarR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 162 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4054  MarR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 174 aa  52  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2294  transcriptional regulator, MarR family protein  27.66 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2561  MarR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 150 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0041  transcriptional regulator, MarR family  38.03 
 
 		 170 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3955  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.420948  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  26.67 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4068  transcriptional regulator, MarR family  30.12 
 
 		 171 aa  51.6  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1448  transcriptional regulator, MarR family  28.78 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.165175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06856  hypothetical protein  30.67 
 
 		 142 aa  51.6  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 161 aa  51.2  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5714  MarR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00966957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1411  MarR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 147 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.168618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1874  MarR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000119555 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 145 aa  50.8  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1285  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 157 aa  50.8  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 183 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1424  transcriptional regulator  32.99 
 
 		 158 aa  50.8  0.000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0154765  hitchhiker  0.000999749 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3908  transcriptional regulator, TrmB  25 
 
 		 148 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2388  transcriptional regulator, MarR family  26.05 
 
 		 164 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.617098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>