213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3480 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3480  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 147 aa  291  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0245944  normal  0.530872 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1381  MarR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 146 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.421757  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3454  MarR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.947902  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4899  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.529551  normal  0.428583 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4809  transcriptional regulator, MarR family  33.58 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.577759  normal  0.746027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0503  transcriptional regulator, MarR family  34.88 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.554707 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1996  transcriptional regulator, MarR family  35.29 
 
 		 172 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0516  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.398648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0807  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6455  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 162 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2046  MarR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 156 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2762  MarR family transcriptional regulator  38 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0803  MarR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14420  transcriptional regulator, MarR family  30.94 
 
 		 161 aa  64.7  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0590  putative transcription regulator protein  32.8 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3429  transcriptional regulator MarR family  32.5 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.905636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  32.48 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  36.23 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0666  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 169 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.10715  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0263  MarR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 151 aa  62  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7084  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2399  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 156 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3027  MarR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 163 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.128021 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3359  hydroxycinnamic acid degradation regulator, putative  30.6 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1703  transcriptional regulator MarR family  32.52 
 
 		 172 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.135356  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  36.45 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0223  transcriptional regulator, MarR family  29.71 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.504687  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2977  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.688657  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2729  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0376267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0565  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1134  MarR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168406  hitchhiker  0.0000997239 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3763  MarR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 154 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1143  MarR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3061  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1722  MarR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0795  MarR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7499  MarR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.800614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2945  transcriptional regulator, MarR family  30.43 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521959  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4536  MarR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.018511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1089  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2934  Transcriptional regulator protein  31.9 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0284  MarR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4858  MarR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 195 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.375603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2271  MarR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 146 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0738352 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1679  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6874  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3125  transcriptional regulator, TrmB  29.73 
 
 		 157 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.402819 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3774  regulatory protein, MarR  27.42 
 
 		 177 aa  51.6  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0783  MarR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 158 aa  52  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2899  regulatory protein MarR  29.73 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.1792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2013  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04625  transcriptional regulator MarR family  38.89 
 
 		 157 aa  51.2  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5092  MarR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 167 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.636455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1483  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.715105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1353  MarR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 157 aa  50.4  0.000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2016  MarR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 167 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.908198 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5296  transcriptional regulator MarR family  31.62 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5190  transcriptional regulator, MarR family  25.77 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0088303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3022  transcriptional regulator, TrmB  29.55 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.195041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2889  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 167 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000416849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6384  MarR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0789  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.232655  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0773  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  31.45 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5531  transcriptional regulator, TrmB  31.11 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.412859  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0603  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.125253  normal  0.477496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6948  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0986  MarR family transcriptional regulator  34 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5030  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 162 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.942025 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5144  MarR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 156 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4869  MarR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03320  transcriptional regulator  35.85 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1546  MarR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 161 aa  47  0.00008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.22368  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1409  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 184 aa  47  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03946  transcriptional regulator MarR family  33.7 
 
 		 143 aa  47  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.828616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3044  MarR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0598  MarR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4909  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4754  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3276  MarR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 168 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5284  MarR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0279  MarR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 158 aa  46.2  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.468058  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5154  transcriptional regulator, MarR family  24.74 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07865e-17 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1828  MarR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0229599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4775  MarR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 164 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0667065  normal  0.0390865 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3382  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 147 aa  46.2  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3125  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0374972  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3704  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 178 aa  45.4  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0457412  normal  0.0618466 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5242  MarR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0359  MarR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.739639  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5695  transcriptional regulator, MarR family  29.49 
 
 		 155 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3155  hypothetical protein  33.33 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3567  transcriptional regulator, MarR family  24.22 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3271  MarR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2138  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 157 aa  45.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.14968  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0324  transcriptional regulator, MarR family  25.6 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.491291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>